186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0138 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0138  resolvase family site-specific recombinase  100 
 
 		 516 aa  1021    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  29.43 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  28.54 
 
 		 534 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  25.97 
 
 		 498 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.66 
 
 		 522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  30.45 
 
 		 547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  28.35 
 
 		 542 aa  111  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  31.76 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.06 
 
 		 546 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  28.09 
 
 		 542 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  28.09 
 
 		 542 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  28.12 
 
 		 521 aa  107  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  23.76 
 
 		 546 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  29.23 
 
 		 515 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  27.15 
 
 		 519 aa  100  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  29.08 
 
 		 522 aa  100  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  27.36 
 
 		 526 aa  99.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  28.53 
 
 		 522 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  27.21 
 
 		 511 aa  98.6  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  28.78 
 
 		 519 aa  93.6  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  25.95 
 
 		 521 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  25.19 
 
 		 479 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  24.38 
 
 		 484 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  23.91 
 
 		 484 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  25.22 
 
 		 520 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  25.85 
 
 		 475 aa  84  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  25.6 
 
 		 487 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  25.89 
 
 		 526 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  26.67 
 
 		 524 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  26.99 
 
 		 606 aa  80.5  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  26.99 
 
 		 606 aa  80.5  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  21.1 
 
 		 613 aa  76.6  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  20.55 
 
 		 665 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  24.37 
 
 		 586 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  23.22 
 
 		 517 aa  76.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  25.13 
 
 		 488 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  26.65 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  26.46 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  26.11 
 
 		 558 aa  74.3  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  25.38 
 
 		 515 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  26.2 
 
 		 515 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  26.43 
 
 		 544 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  26.19 
 
 		 506 aa  72.4  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  27.03 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  26.69 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  28.45 
 
 		 523 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  25.73 
 
 		 552 aa  71.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  28.15 
 
 		 523 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  24.32 
 
 		 535 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  24.62 
 
 		 534 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  28.11 
 
 		 546 aa  69.3  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  23.47 
 
 		 547 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  25.29 
 
 		 511 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  23.85 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  23.85 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  24.64 
 
 		 539 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  23.99 
 
 		 542 aa  68.2  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  23.7 
 
 		 561 aa  67.8  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  23.56 
 
 		 552 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  24.11 
 
 		 558 aa  67.4  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  23.52 
 
 		 548 aa  66.6  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  26.28 
 
 		 489 aa  66.2  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  22.28 
 
 		 528 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  24.08 
 
 		 563 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  23.99 
 
 		 554 aa  65.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  22.3 
 
 		 641 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  24.94 
 
 		 552 aa  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  23.33 
 
 		 555 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  23.06 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  23.65 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  23.31 
 
 		 550 aa  65.1  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  22.42 
 
 		 528 aa  65.1  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  21.14 
 
 		 513 aa  65.1  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  24.34 
 
 		 543 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  23.97 
 
 		 485 aa  64.3  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  22.59 
 
 		 534 aa  63.9  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  25.92 
 
 		 500 aa  63.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  24.11 
 
 		 626 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  24.66 
 
 		 518 aa  63.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  22.19 
 
 		 532 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  25.07 
 
 		 603 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  23.95 
 
 		 505 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  21.32 
 
 		 509 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  25.07 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  25.36 
 
 		 553 aa  61.6  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  23.69 
 
 		 541 aa  61.6  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  22.94 
 
 		 537 aa  62  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  23.98 
 
 		 537 aa  61.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  23.95 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  24.47 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  24.06 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  25.67 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  21.54 
 
 		 598 aa  60.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  24.39 
 
 		 518 aa  60.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  24.53 
 
 		 523 aa  60.5  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  25.08 
 
 		 500 aa  59.7  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  28.65 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  23.64 
 
 		 539 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26050  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  22.49 
 
 		 511 aa  59.7  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  25.97 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>