More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0445 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0445  resolvase/integrase-like protein  100 
 
 		 192 aa  388  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.65944  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2637  resolvase domain-containing protein  43.24 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  39.04 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  39.04 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  39.04 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  40 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  40.64 
 
 		 194 aa  115  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  38.59 
 
 		 195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  38.42 
 
 		 219 aa  111  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  42.11 
 
 		 184 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  41.58 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  38.04 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  35.53 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  38.34 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  38.34 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  36.02 
 
 		 188 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  37.36 
 
 		 188 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  36.61 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  37.23 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  35.48 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  37.23 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  37.23 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  37.91 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  37.91 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  35.33 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  33.69 
 
 		 190 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  33.69 
 
 		 190 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  33.69 
 
 		 190 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 		 307 aa  105  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 		 307 aa  105  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  34.78 
 
 		 191 aa  104  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  34.78 
 
 		 191 aa  104  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  37.91 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  36.76 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  42.28 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  34.05 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  36.61 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  34.78 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  37.43 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  36.22 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 		 196 aa  101  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  34.78 
 
 		 188 aa  101  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  37.97 
 
 		 309 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  35.64 
 
 		 193 aa  101  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  37.7 
 
 		 197 aa  100  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  36.76 
 
 		 188 aa  101  9e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  35.87 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  35.87 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  36.84 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  36.96 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  35.71 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  36.16 
 
 		 203 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  36.73 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  35.68 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  35.33 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  34.57 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  38.8 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  35.33 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  35.33 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  36.76 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  33.51 
 
 		 185 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A23  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  35.75 
 
 		 187 aa  97.8  8e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  35.68 
 
 		 185 aa  97.8  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  36.41 
 
 		 201 aa  97.8  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  33.7 
 
 		 214 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  34.81 
 
 		 188 aa  97.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  35.33 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  33.69 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  34.59 
 
 		 228 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  39.33 
 
 		 213 aa  95.9  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 		 206 aa  95.5  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  35.87 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 		 196 aa  95.9  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 		 206 aa  95.5  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  39.87 
 
 		 293 aa  95.5  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  32.46 
 
 		 224 aa  94.7  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  40.37 
 
 		 305 aa  95.1  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 298 aa  94.7  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  34.57 
 
 		 198 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  33.88 
 
 		 193 aa  94.4  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  38.04 
 
 		 189 aa  94.4  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  35.14 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 293 aa  94  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6376  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  35.11 
 
 		 185 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  33.68 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  36.77 
 
 		 326 aa  94  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  35.29 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  37.96 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  35.83 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>