More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2637 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2637  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0445  resolvase/integrase-like protein  43.24 
 
 		 192 aa  143  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.65944  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 188 aa  123  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  39.55 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  41.85 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  41.85 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  41.85 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  39.38 
 
 		 189 aa  117  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  38.76 
 
 		 197 aa  114  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  38.2 
 
 		 184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  36.26 
 
 		 192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  45.64 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  38.76 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  40.11 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  38.8 
 
 		 198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  38.98 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  38.42 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  38.42 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  41.83 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  36.76 
 
 		 190 aa  111  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  38.42 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  38.42 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  39.55 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  36.72 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  38.2 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  37.85 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  36.22 
 
 		 190 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  38 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  38.04 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  36.16 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  35.75 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3660  resolvase domain-containing protein  37.02 
 
 		 202 aa  108  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  35.75 
 
 		 190 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  35.75 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  39.87 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  37.22 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  36.72 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  38.12 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  37.22 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  35.56 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  38.98 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  37.85 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  38.76 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  37.85 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  37.85 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  36.31 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  36.31 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  37.29 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  37.29 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  37.29 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  37.29 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  37.29 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  36.31 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  39.55 
 
 		 203 aa  104  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  40.33 
 
 		 194 aa  104  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  37.29 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  38.33 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  35.16 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  36.46 
 
 		 197 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  36.46 
 
 		 197 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  36.67 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  36.87 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  37.78 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  35.03 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  35.91 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  36.16 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  36.11 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  36.26 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  38.65 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  35.52 
 
 		 194 aa  101  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  35.52 
 
 		 194 aa  101  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  36.67 
 
 		 228 aa  101  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 		 201 aa  101  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  42.07 
 
 		 201 aa  100  9e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  37.99 
 
 		 179 aa  100  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  36.99 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  42.18 
 
 		 309 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  34.81 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  35.03 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  34.05 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  36.11 
 
 		 290 aa  99.4  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  41.56 
 
 		 184 aa  99.4  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3748  resolvase domain-containing protein  42.25 
 
 		 293 aa  98.2  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57685  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  41.46 
 
 		 184 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  34.43 
 
 		 185 aa  98.2  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  34.43 
 
 		 185 aa  98.2  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  34.43 
 
 		 185 aa  98.2  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  34.43 
 
 		 185 aa  98.2  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  34.43 
 
 		 185 aa  98.2  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  34.43 
 
 		 185 aa  97.8  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  33.71 
 
 		 201 aa  97.8  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  41.38 
 
 		 199 aa  97.4  9e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  35.03 
 
 		 188 aa  97.4  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  36.41 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2396  resolvase domain-containing protein  41.78 
 
 		 163 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.718289  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>