More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4488 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  100 
 
 		 187 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  54.01 
 
 		 197 aa  217  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  55.56 
 
 		 184 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  55.56 
 
 		 184 aa  210  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  52.78 
 
 		 188 aa  209  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  51.38 
 
 		 189 aa  197  7.999999999999999e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  45.11 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  45.6 
 
 		 187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  45.11 
 
 		 190 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  43.96 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  43.96 
 
 		 185 aa  167  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  43.17 
 
 		 188 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  42.31 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  43.72 
 
 		 185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  43.72 
 
 		 185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  43.33 
 
 		 188 aa  157  7e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  43.96 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  39.89 
 
 		 185 aa  150  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  44.13 
 
 		 193 aa  150  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  41.34 
 
 		 189 aa  149  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  43.43 
 
 		 191 aa  148  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  43.43 
 
 		 191 aa  148  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  42.22 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  40.91 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  40.91 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  41.08 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  43.1 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  39.77 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  41.57 
 
 		 201 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  40.45 
 
 		 188 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  41.21 
 
 		 193 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  41.21 
 
 		 193 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  41.24 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  38.25 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  40.88 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  40.88 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  39.15 
 
 		 307 aa  134  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 		 193 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  41.78 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  39.15 
 
 		 307 aa  134  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  47.22 
 
 		 184 aa  134  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 		 193 aa  134  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  40.96 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  38.42 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  40.78 
 
 		 194 aa  131  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  40.78 
 
 		 194 aa  131  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  40.66 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  39.33 
 
 		 188 aa  130  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  45.22 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  39.57 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  39.57 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  37.71 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  39.57 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  39.33 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  46.48 
 
 		 309 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  37.57 
 
 		 201 aa  127  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  41.27 
 
 		 201 aa  126  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  39.55 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  37.97 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  37.97 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  37.97 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  39.11 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  40.91 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  38.76 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  37.64 
 
 		 203 aa  124  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4931  resolvase domain-containing protein  46.77 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107506  normal  0.566204 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  39.62 
 
 		 313 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  43.87 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  39.01 
 
 		 192 aa  121  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  38.55 
 
 		 309 aa  121  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  37.99 
 
 		 184 aa  120  9e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  43.8 
 
 		 293 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  43.07 
 
 		 298 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  43.8 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3748  resolvase domain-containing protein  44.53 
 
 		 293 aa  117  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57685  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  37.43 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  43.8 
 
 		 324 aa  117  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  37.44 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  34.64 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  45.21 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  37.43 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  43.71 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  42.57 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4320  hypothetical protein  43.8 
 
 		 293 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.264253 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2482  TonB-dependent receptor protein  42.34 
 
 		 294 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  37.64 
 
 		 194 aa  114  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  44.52 
 
 		 197 aa  114  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  37.99 
 
 		 196 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  41.61 
 
 		 294 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  37.14 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  38.34 
 
 		 204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  38.1 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  39.63 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  34.66 
 
 		 190 aa  111  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  36.27 
 
 		 204 aa  111  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  36.27 
 
 		 204 aa  111  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  36.27 
 
 		 204 aa  111  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  40.49 
 
 		 204 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>