More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4538 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011881  Achl_4538  Resolvase domain protein  100 
 
 		 147 aa  293  6e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.696146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  40.41 
 
 		 193 aa  104  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  41.3 
 
 		 188 aa  102  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  41.3 
 
 		 185 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  41.3 
 
 		 185 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  38.89 
 
 		 197 aa  101  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  45 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  41.3 
 
 		 185 aa  100  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  40.58 
 
 		 188 aa  100  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  41.3 
 
 		 193 aa  100  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  38.03 
 
 		 198 aa  99.8  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  40.58 
 
 		 185 aa  99.4  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  39.46 
 
 		 188 aa  98.2  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  40.58 
 
 		 185 aa  97.1  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  41.01 
 
 		 185 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  41.73 
 
 		 185 aa  95.9  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  42.14 
 
 		 183 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  42.14 
 
 		 183 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  39.72 
 
 		 181 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  40.41 
 
 		 201 aa  94  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  47.46 
 
 		 191 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  47.46 
 
 		 191 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  39.31 
 
 		 188 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  41.35 
 
 		 197 aa  90.1  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  38.73 
 
 		 196 aa  90.5  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  39.73 
 
 		 194 aa  89.7  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  40.58 
 
 		 201 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  39.86 
 
 		 188 aa  89  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  50.51 
 
 		 184 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  38.13 
 
 		 190 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  40.29 
 
 		 197 aa  87.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  49.49 
 
 		 184 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  37.68 
 
 		 188 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  39.47 
 
 		 176 aa  87  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  36.03 
 
 		 192 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  37.68 
 
 		 190 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  37.68 
 
 		 187 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  37.88 
 
 		 195 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  48.48 
 
 		 197 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  36.88 
 
 		 205 aa  84.3  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  39.44 
 
 		 198 aa  84  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 		 193 aa  84  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  43.88 
 
 		 190 aa  84  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  48.45 
 
 		 189 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  40 
 
 		 182 aa  83.6  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  38.97 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  35.77 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  41.3 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  35.77 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  45.26 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  36.43 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4731  Resolvase domain protein  41.73 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  39.42 
 
 		 209 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  37.96 
 
 		 184 aa  80.5  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  35.25 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  36.69 
 
 		 199 aa  80.5  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  36.84 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  35.42 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  41.98 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  41.98 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  36.88 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  36.96 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  39.42 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  36.55 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  39.42 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  38.24 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  38.24 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  39.42 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1209  putative resolvase  38.85 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  38.3 
 
 		 206 aa  77.4  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  39.13 
 
 		 203 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 231 aa  77  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  35.97 
 
 		 190 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  37.76 
 
 		 204 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  37.76 
 
 		 204 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  37.76 
 
 		 204 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  36.43 
 
 		 191 aa  77  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  39.01 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  39.01 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  33.81 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  36.64 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  38.97 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  38.13 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  35.25 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  34.53 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  36.96 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  36.76 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  34.51 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  36.84 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  36.5 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  31.94 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  34.85 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  34.78 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  33.33 
 
 		 193 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  31.65 
 
 		 188 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  33.8 
 
 		 187 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  36.03 
 
 		 193 aa  73.9  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 		 201 aa  73.6  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>