217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpl0053 on replicon NC_006366
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006366  plpl0053  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  186  5.999999999999999e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  54.67 
 
 		 191 aa  92.8  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  46.15 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  46.07 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  44 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  42.86 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  41.77 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  44.74 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  45.33 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  44.87 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  44.74 
 
 		 183 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  43.42 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  41.33 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  41.33 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  38.96 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  41.25 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  38.46 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  38.46 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  40.91 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  41.33 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  45 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  42.67 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  34.02 
 
 		 188 aa  63.5  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  40.54 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  46.48 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  45.07 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  37.66 
 
 		 188 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  42.86 
 
 		 218 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  37.66 
 
 		 184 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  40.79 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  44 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1209  putative resolvase  40 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  41.33 
 
 		 463 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  44.16 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  40 
 
 		 204 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  40 
 
 		 204 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  40 
 
 		 204 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  44.16 
 
 		 190 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  44.16 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  40 
 
 		 204 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  41.03 
 
 		 198 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  44.44 
 
 		 191 aa  60.1  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 		 191 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  48.05 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  40.51 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2979  resolvase domain-containing protein  38.96 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  42.86 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  42.86 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  36.84 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  39.19 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  43.84 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0696  resolvase-like protein  46.75 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  49.33 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  40.79 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  42.86 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  42.86 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  43.66 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  43.75 
 
 		 307 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  43.75 
 
 		 307 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  42.67 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  40.79 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  47.25 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  41.67 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  35.44 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  41.56 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  40.79 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0002  DNA-invertase, C-terminal region  38.96 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2304  hypothetical protein  69.23 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  36 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  41.33 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  41.33 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  41.56 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  41.33 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  41.33 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  38.96 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  46.67 
 
 		 184 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  40.26 
 
 		 185 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  44.16 
 
 		 194 aa  52.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0212  resolvase  43.55 
 
 		 69 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171512 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 193 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  45.33 
 
 		 184 aa  52  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  44 
 
 		 188 aa  52  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  33.77 
 
 		 194 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  33.73 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  33.73 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  39.47 
 
 		 206 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  33.73 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  40.26 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  36.11 
 
 		 193 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  36.11 
 
 		 193 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  42.86 
 
 		 194 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  42.86 
 
 		 194 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  55.77 
 
 		 189 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  43.1 
 
 		 176 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>