223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2304 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2304  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  162  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  70.91 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  85.37 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  82.93 
 
 
186 aa  73.9  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  80.49 
 
 
191 aa  70.5  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  56.92 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  80 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  64.44 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  70.73 
 
 
219 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  45.21 
 
 
201 aa  63.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  68.29 
 
 
191 aa  63.5  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  68.29 
 
 
191 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0026c  DNA integration/recombination/inversion protein  73.17 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  65.22 
 
 
201 aa  62  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  55.93 
 
 
201 aa  62  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  66.67 
 
 
197 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  73.17 
 
 
205 aa  61.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  48.44 
 
 
224 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  73.81 
 
 
215 aa  61.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  70.73 
 
 
197 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  70 
 
 
184 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  67.5 
 
 
184 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  65.85 
 
 
189 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  65.85 
 
 
188 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  68.29 
 
 
198 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  60.98 
 
 
193 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  67.44 
 
 
204 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  67.44 
 
 
204 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  65.85 
 
 
188 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  68.29 
 
 
197 aa  58.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  66.67 
 
 
190 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  66.67 
 
 
190 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  66.67 
 
 
190 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  69.23 
 
 
198 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  67.44 
 
 
463 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  67.44 
 
 
210 aa  57  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  52 
 
 
185 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  52 
 
 
185 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  65.85 
 
 
307 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  65.85 
 
 
307 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0053  hypothetical protein  69.23 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  69.23 
 
 
309 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  69.44 
 
 
209 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  65.12 
 
 
204 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  65.12 
 
 
204 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  65.12 
 
 
204 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  63.41 
 
 
182 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1209  putative resolvase  65.12 
 
 
176 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  60.98 
 
 
176 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  63.16 
 
 
189 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  63.16 
 
 
189 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  63.41 
 
 
192 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  62.79 
 
 
204 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  60.98 
 
 
188 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  65.85 
 
 
184 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  50 
 
 
185 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  58.54 
 
 
196 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
185 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  50 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  56.1 
 
 
186 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  64.1 
 
 
184 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  60.98 
 
 
218 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  57.14 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  55.26 
 
 
199 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  60.98 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  65.85 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  58.14 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  50 
 
 
188 aa  51.6  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  60.47 
 
 
206 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  39.71 
 
 
183 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  56.52 
 
 
203 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  52.27 
 
 
197 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  50 
 
 
185 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  48.89 
 
 
194 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  39.71 
 
 
183 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  48.89 
 
 
194 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  66.67 
 
 
197 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  66.67 
 
 
197 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  58.54 
 
 
184 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  58.54 
 
 
194 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  58.54 
 
 
184 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  43.1 
 
 
206 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
185 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0002  DNA-invertase, C-terminal region  59.46 
 
 
114 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  56.1 
 
 
189 aa  50.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  52.63 
 
 
201 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  57.14 
 
 
181 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  61.11 
 
 
191 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  38.67 
 
 
188 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  61.11 
 
 
197 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  61.11 
 
 
197 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  57.89 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  61.11 
 
 
197 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  61.11 
 
 
192 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  57.5 
 
 
201 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
188 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2979  resolvase domain-containing protein  51.22 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  57.14 
 
 
184 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  55 
 
 
199 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0381075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>