262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_A0026c on replicon NC_009726
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009726  CBUD_A0026c  DNA integration/recombination/inversion protein  100 
 
 
88 aa  179  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  78.57 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  66.67 
 
 
189 aa  72  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  73.91 
 
 
191 aa  70.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  59.62 
 
 
194 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  66 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  76.19 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  73.81 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  55.56 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  55.56 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  60.78 
 
 
197 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  60 
 
 
187 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  76.92 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  76.92 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  64.44 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  64.44 
 
 
196 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  62.5 
 
 
463 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  65.96 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  69.23 
 
 
309 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2304  hypothetical protein  73.17 
 
 
77 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  66.67 
 
 
307 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  66.67 
 
 
307 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  69.05 
 
 
206 aa  62  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  68.09 
 
 
205 aa  62  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  49.06 
 
 
194 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  49.06 
 
 
194 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  53.85 
 
 
192 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  74.36 
 
 
204 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  61.7 
 
 
194 aa  60.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  60.42 
 
 
183 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  63.41 
 
 
198 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  63.41 
 
 
184 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  57.14 
 
 
188 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  56.25 
 
 
184 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1209  putative resolvase  74.36 
 
 
176 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  40.54 
 
 
218 aa  60.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  57.14 
 
 
184 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  63.41 
 
 
197 aa  60.1  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  74.36 
 
 
204 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  74.36 
 
 
204 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  74.36 
 
 
204 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  61.7 
 
 
204 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  61.7 
 
 
204 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  50.98 
 
 
193 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  52.83 
 
 
197 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  60.42 
 
 
184 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  64.1 
 
 
198 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  71.79 
 
 
210 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  42.03 
 
 
194 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  55.1 
 
 
189 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  58.18 
 
 
187 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  53.06 
 
 
196 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  55.1 
 
 
184 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  50.94 
 
 
196 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  58.18 
 
 
190 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  50.94 
 
 
196 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  50.94 
 
 
196 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  65 
 
 
209 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  57.45 
 
 
189 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  58.54 
 
 
176 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  52.54 
 
 
188 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  50.91 
 
 
188 aa  57  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  51.02 
 
 
196 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  51.02 
 
 
196 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  51.02 
 
 
196 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  51.02 
 
 
196 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  61.7 
 
 
215 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  51.02 
 
 
196 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  64.1 
 
 
197 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  64.1 
 
 
197 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  51.02 
 
 
196 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  57.45 
 
 
188 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  56.6 
 
 
203 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  42 
 
 
190 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  42 
 
 
189 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  51.02 
 
 
196 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  51.02 
 
 
196 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  52 
 
 
193 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  54.35 
 
 
181 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  57.5 
 
 
199 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  55 
 
 
201 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  53.33 
 
 
183 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  48.15 
 
 
185 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  48.15 
 
 
185 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  53.33 
 
 
183 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  51.85 
 
 
189 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  40.68 
 
 
213 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  54.17 
 
 
189 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  49.02 
 
 
206 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  54.17 
 
 
189 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  58.14 
 
 
204 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  43.4 
 
 
191 aa  53.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  48.98 
 
 
201 aa  53.9  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  54.76 
 
 
197 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  53.06 
 
 
293 aa  53.5  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  54.76 
 
 
197 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  54.76 
 
 
197 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  54.76 
 
 
192 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  44.26 
 
 
188 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  53.06 
 
 
326 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>