175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2023 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2023  resolvase helix-turn-helix region  100 
 
 		 78 aa  159  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  87.01 
 
 		 185 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  83.33 
 
 		 185 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  83.12 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  84 
 
 		 185 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  80 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  80 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  82.43 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  81.33 
 
 		 185 aa  127  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  77.33 
 
 		 188 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  72.73 
 
 		 188 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  66.67 
 
 		 193 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  66.67 
 
 		 193 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3342  ISSod9, DNA-invertase  80.95 
 
 		 43 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0147293  normal  0.421266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  46.75 
 
 		 184 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  50.68 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  46.75 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  46.67 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  46.67 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  45.33 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  40.28 
 
 		 184 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  44.16 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0002  DNA-invertase, C-terminal region  38.96 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  45.33 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  47.95 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  47.37 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  44.59 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  43.24 
 
 		 191 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  45.07 
 
 		 198 aa  57  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  41.67 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1164  DNA-invertase  45.71 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  45.21 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  44.87 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4731  Resolvase domain protein  42.47 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  45.33 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  41.1 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  44.93 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  41.1 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  35.9 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  41.1 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  45.71 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  43.24 
 
 		 182 aa  53.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  42.31 
 
 		 197 aa  53.5  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  41.98 
 
 		 201 aa  53.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  46.67 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  46.67 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  46.67 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  35.53 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4538  Resolvase domain protein  37.5 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.696146 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  35.53 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  36.84 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1209  putative resolvase  45.21 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  36.99 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  36.99 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  36.11 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  36.11 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  46.05 
 
 		 218 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  42.03 
 
 		 191 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  48.57 
 
 		 199 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  43.48 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  42.03 
 
 		 191 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  41.67 
 
 		 203 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 185 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 185 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 185 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 185 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 185 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  41.1 
 
 		 195 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  50.65 
 
 		 184 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  37.5 
 
 		 205 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  45.33 
 
 		 204 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  34.72 
 
 		 201 aa  50.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  34.72 
 
 		 201 aa  50.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  40.54 
 
 		 198 aa  50.1  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  34.72 
 
 		 186 aa  50.4  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  34.72 
 
 		 186 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  34.72 
 
 		 186 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  34.72 
 
 		 186 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  34.72 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  34.72 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3256  Fis family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0578977  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  38.36 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  34.72 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  34.72 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  34.72 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  40 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  34.21 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  40.51 
 
 		 208 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  39.44 
 
 		 188 aa  48.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  34.72 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  43.24 
 
 		 228 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  38.16 
 
 		 198 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  40.85 
 
 		 219 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  39.47 
 
 		 463 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  34.72 
 
 		 188 aa  47.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2979  resolvase domain-containing protein  37.8 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  40.54 
 
 		 206 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  33.33 
 
 		 186 aa  47.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  44.12 
 
 		 189 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>