217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5525 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5525  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  326  7e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  75.86 
 
 		 191 aa  130  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  73.56 
 
 		 192 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  73.56 
 
 		 197 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  73.56 
 
 		 197 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  73.56 
 
 		 197 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  63.04 
 
 		 194 aa  103  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  63.04 
 
 		 194 aa  103  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3497  resolvase domain-containing protein  64.13 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503079  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3570  resolvase domain-containing protein  64.13 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3606  resolvase domain-containing protein  64.13 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996271 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1104  resolvase domain-containing protein  64.13 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  49.41 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  55.56 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  50.75 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  52.24 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  42.42 
 
 		 463 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  48.24 
 
 		 191 aa  73.9  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  48.24 
 
 		 191 aa  73.9  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0002  DNA-invertase, C-terminal region  35.58 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  50 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  38.71 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  46.15 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  49.3 
 
 		 182 aa  72  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  39.6 
 
 		 201 aa  72  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  55.38 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  45.83 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  54.55 
 
 		 209 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  55.38 
 
 		 197 aa  70.9  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  53.85 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  37.38 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  42.68 
 
 		 188 aa  67.4  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  42.68 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  37.96 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  37.96 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  42.68 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  42.17 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  49.33 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  41.67 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  49.21 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  48.57 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  47.89 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  46.27 
 
 		 309 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  46.48 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  48.57 
 
 		 228 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  40.48 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  39.62 
 
 		 204 aa  63.9  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  39.62 
 
 		 204 aa  63.9  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  39.62 
 
 		 204 aa  63.9  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  43.42 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1209  putative resolvase  38.68 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  37.04 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  44.93 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  47.76 
 
 		 214 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  43.28 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  43.28 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  46.48 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  44.93 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  34.94 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  49.23 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  46.97 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  46.97 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  38.3 
 
 		 201 aa  60.5  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  38.68 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  37.74 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  36.89 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  36.89 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  47.69 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  48.57 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  48.57 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  44.78 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  40 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  42.25 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  39.76 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  41.67 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  39.76 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  39.76 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  42.86 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  42.65 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  36.45 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  40.86 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  45.59 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  48.33 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  36.47 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  38.1 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  29.46 
 
 		 203 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  44.62 
 
 		 294 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  34.78 
 
 		 199 aa  57  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  35.58 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  34.31 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  40.96 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  40.96 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  55.77 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  41.67 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  43.66 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  48.33 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>