26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0127 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0127  resolvase family site-specific recombinase  100 
 
 		 87 aa  181  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.364122  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  57.81 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  48.68 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  50.68 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  46.05 
 
 		 210 aa  60.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  47.37 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  50.85 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  46.05 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  47.95 
 
 		 209 aa  57.4  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  46.97 
 
 		 205 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  51.67 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  51.67 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  45.21 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  42.47 
 
 		 205 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  55.56 
 
 		 207 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  47.69 
 
 		 202 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  47.69 
 
 		 202 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  47.69 
 
 		 202 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  34.62 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  42.03 
 
 		 220 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  34.62 
 
 		 213 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  36.99 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  39.71 
 
 		 208 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  35.9 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  48.08 
 
 		 210 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  33.33 
 
 		 208 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>