158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2671 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2671  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 101 aa  209  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1499  transcriptional regulator, MerR family  89.47 
 
 		 99 aa  179  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000339204  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2513  glutamine synthetase repressor  49.23 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.218965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3470  MerR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.003509  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  47.22 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3732  transcriptional repressor GlnR  47.69 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3550  transcriptional repressor GlnR  47.69 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3450  MerR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3463  MerR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3834  transcriptional repressor GlnR  47.69 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1501  transcriptional repressor GlnR  47.69 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0247107 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3804  transcriptional repressor GlnR  47.69 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3755  transcriptional repressor GlnR  47.69 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0446973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3714  transcriptional repressor GlnR  47.69 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57009e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2382  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.492315  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0716  glutamine synthetase repressor  40.7 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0875  glutamine synthetase repressor  46.15 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1764  transcriptional regulator GlnR  39.39 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.105299  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1752  glutamine synthetase transcriptional regulator  40.58 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000396501  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1367  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0398915  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1393  glutamine synthetase repressor  44.62 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.155382  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.28 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  30.21 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0951  glutamine synthetase repressor  44.44 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.394766  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  36.36 
 
 		 286 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  32.14 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  36.99 
 
 		 92 aa  47.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 179 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  46.88 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 282 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2141  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0481912  normal  0.077667 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1319  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 174 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0539  transcriptional regulator, MerR family  36.67 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 253 aa  44.3  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  47.62 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1215  transcriptional regulator, MerR family  39.68 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  32.05 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  41.07 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  40.54 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  32.31 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4236  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0727  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.24639 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4130  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  40.91 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3677  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 692 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.819629  normal  0.434964 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3389  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879982 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 166 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4827  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 137 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  39.68 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 251 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 254 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 251 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 251 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  40.32 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3026  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.38 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06131  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  35.38 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1266  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.38 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0668949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3164  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0023  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 239 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  34.15 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>