More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0875 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0875  glutamine synthetase repressor  100 
 
 		 121 aa  246  6e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1367  MerR family transcriptional regulator  85.95 
 
 		 122 aa  218  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0398915  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1393  glutamine synthetase repressor  85.95 
 
 		 122 aa  218  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.155382  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 134 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  43.51 
 
 		 133 aa  106  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3732  transcriptional repressor GlnR  41.94 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3550  transcriptional repressor GlnR  41.94 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3450  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3463  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3755  transcriptional repressor GlnR  41.94 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0446973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3834  transcriptional repressor GlnR  41.94 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3804  transcriptional repressor GlnR  41.94 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1501  transcriptional repressor GlnR  41.94 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0247107 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3714  transcriptional repressor GlnR  41.94 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57009e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2382  MerR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 129 aa  93.6  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.492315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3470  MerR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.003509  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1764  transcriptional regulator GlnR  50 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.105299  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1752  glutamine synthetase transcriptional regulator  56.34 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000396501  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2513  glutamine synthetase repressor  55.56 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.218965  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  52 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0716  glutamine synthetase repressor  40.22 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0951  glutamine synthetase repressor  40.26 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.394766  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  37.61 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  39.76 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  36.47 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  36.62 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1450  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.225656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  35.9 
 
 		 144 aa  62  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  38.67 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  36.9 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  35.71 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  39.73 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1279  transcriptional regulator, MerR family  35.21 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1215  transcriptional regulator, MerR family  39.44 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  34.41 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  33.91 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  36.62 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0455  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  42.65 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2671  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 101 aa  57  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  41.67 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2725  MerR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1531  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.896472  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2415  transcriptional regulator MlrA  33.33 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  36.71 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1520  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1499  transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000339204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02014  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0917  transcriptional regulator MlrA  33.33 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1874  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.174195  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5468  transcriptional regulator, MerR family  35.06 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0526  putative transcriptional regulator, MerR family  37.65 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  32.22 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2350  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 243 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  34.29 
 
 		 243 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 243 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 243 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1066  cation-efflux system membrane protein  41.18 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000356416  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2399  transcriptional regulator, MerR family protein  34.29 
 
 		 243 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  32.88 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0360  MerR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000341554  normal  0.726839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  35.14 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 98 aa  52  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  37.31 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1381  regulatory protein MerR  39.71 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0443  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4230  putative transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 		 140 aa  50.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0585976  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0244  MerR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448953 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4233  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  36.99 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  31.08 
 
 		 195 aa  50.4  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  37.31 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  39.13 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  35.29 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  35.29 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 179 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>