229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0539 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0539  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 111 aa  218  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1302  transcriptional regulator, MerR family  60.56 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1518  MerR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0727  transcriptional regulator  39.36 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.24639 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0045  MerR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1369  transcriptional regulator, MerR family  55.36 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000004274 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  29.17 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2844  transcriptional regulator, MerR family  51.79 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00099405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 255 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1752  glutamine synthetase transcriptional regulator  35.06 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000396501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1336  MerR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0878  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00904238  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1400  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 255 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1329  transcriptional regulator, MerR family  40.98 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000199488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2954  transcriptional regulator, MerR family  40.98 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0887  MerR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0416797  hitchhiker  0.00000266118 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1724  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  33.9 
 
 		 303 aa  47.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3106  regulator of pmrA, putative  40.91 
 
 		 257 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1058  transcriptional regulator, MerR family  42.17 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1596  transcriptional regulator, MerR family  43.06 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.265626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0840  transcriptional regulator, MerR family  46.88 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04765  putative transcriptional regulator protein  37.21 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.397475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  37.7 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5717  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3439  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 273 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5668  transcriptional regulator, MerR family  40.68 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2513  glutamine synthetase repressor  36.92 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.218965  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1471  transcriptional regulator domain-containing protein  35.79 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1889  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171431  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1408  transcriptional regulator, MerR family  35.79 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00332069  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  28.33 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0494  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0739492  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  31.82 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  33.87 
 
 		 304 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  32.05 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  29.58 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  30.65 
 
 		 302 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  30.49 
 
 		 333 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2182  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 267 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.565619  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  29.03 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3239  transcriptional regulator, MerR family  35.59 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000227315  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2671  transcriptional regulator, MerR family  36.67 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1705  transcriptional regulator, MerR family  42.25 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310194  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1499  transcriptional regulator, MerR family  37.1 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000339204  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  32.31 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  37.1 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1378  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0815083  normal  0.541754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  30.51 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3677  MerR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 692 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.819629  normal  0.434964 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  35.59 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2749  transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  33.33 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10940  transcriptional regulator, MerR family  35.59 
 
 		 153 aa  43.5  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0836  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4029  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 702 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1764  transcriptional regulator GlnR  32.31 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.105299  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1089  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1320  transcriptional regulator, MerR family  29.31 
 
 		 254 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1014  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986669 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1898  MerR family regulatory protein  35.82 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 125 aa  42.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1551  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.724017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4622  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1501  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.259398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1459  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2588  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1000  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.861508  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1482  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.858746  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 345 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1532  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.591284  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0196  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1719  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1742  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0970  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1494  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  36.21 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  38.3 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1008  transcriptional regulator, MerR family  36.59 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>