More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1369 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1369  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 134 aa  270  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000004274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2844  transcriptional regulator, MerR family  94.7 
 
 		 134 aa  254  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00099405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1329  transcriptional regulator, MerR family  69.23 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000199488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1336  MerR family transcriptional regulator  71.32 
 
 		 134 aa  191  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2954  transcriptional regulator, MerR family  68.46 
 
 		 142 aa  190  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1724  MerR family transcriptional regulator  59.2 
 
 		 134 aa  160  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1400  MerR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1599  MerR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 131 aa  103  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  30.7 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  33.86 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  30.36 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  33.86 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  30.51 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  33.07 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5494  transcriptional regulator, MerR family  33.07 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2189  transcriptional regulator, MerR family  30.84 
 
 		 213 aa  60.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0734  regulatory protein, MerR  30.89 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.308445  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1511  regulatory protein, MerR  34.19 
 
 		 178 aa  60.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4192  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0102  regulatory protein, MerR  37.23 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  31.13 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  35.92 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3063  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.858131  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  29.66 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  27.43 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4935  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327998  normal  0.0174485 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  33.96 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  28.7 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2796  MerR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0453  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4735  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0576  MerR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0456359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  29.17 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4372  MerR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5993  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000699442 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2866  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  31.25 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  29.09 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  30.09 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  28.32 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  27.93 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  28.7 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  28.32 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  30.33 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  31.53 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  28.32 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  28.32 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2244  regulatory protein, MerR  30.83 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  27.43 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 190 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3843  MerR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>