More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2844 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2844  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 134 aa  270  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00099405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1369  transcriptional regulator, MerR family  94.7 
 
 		 134 aa  254  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000004274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1329  transcriptional regulator, MerR family  70.77 
 
 		 142 aa  196  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000199488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1336  MerR family transcriptional regulator  72.09 
 
 		 134 aa  194  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2954  transcriptional regulator, MerR family  70 
 
 		 142 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1724  MerR family transcriptional regulator  58.4 
 
 		 134 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1400  MerR family transcriptional regulator  55 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1599  MerR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0102  regulatory protein, MerR  32.59 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4192  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  30.36 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1511  regulatory protein, MerR  36.96 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0734  regulatory protein, MerR  30.89 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.308445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  33.07 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0453  MerR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2866  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  33.07 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3058  transcriptional regulator, MerR family  30.95 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3780  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4372  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3843  MerR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5993  MerR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000699442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3063  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.858131  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  30.83 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  30.83 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  32.43 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  28.81 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5494  transcriptional regulator, MerR family  32.28 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  32.28 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2244  regulatory protein, MerR  30.56 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2796  MerR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4935  MerR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327998  normal  0.0174485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4735  transcriptional regulator, MerR family  29.46 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  44.16 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  31.15 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  34.95 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2996  transcriptional regulator, MerR family  30.47 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2189  transcriptional regulator, MerR family  28.97 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  33.02 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1569  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2726  transcriptional regulator, MerR family protein  28.46 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505695  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  31.15 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  32.43 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  30.84 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  28.44 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05481  hypothetical protein  31.13 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  27.97 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001544  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  32.17 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1898  transcriptional regulator, putative  28.79 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2478  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.263723 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  34.26 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  27.43 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2972  MerR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.54764  normal  0.504684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>