40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2133 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2133  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 252 aa  507  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1738  DNA binding domain-containing protein  84 
 
 		 272 aa  407  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  35.62 
 
 		 571 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  34.68 
 
 		 718 aa  60.1  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 1279 aa  58.9  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  39.24 
 
 		 719 aa  58.9  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.69 
 
 		 1079 aa  57  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 1239 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 1322 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0700  DNA binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 144 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000271881  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  49.02 
 
 		 56 aa  52.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  44.68 
 
 		 139 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  32.48 
 
 		 317 aa  50.1  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.61 
 
 		 758 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  40.68 
 
 		 70 aa  49.7  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0818  EAL and GGDEF domain-containing protein  37.76 
 
 		 976 aa  49.7  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4254  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 62 aa  49.3  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631275  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4598  DNA binding domain protein, excisionase family  47.83 
 
 		 76 aa  48.9  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 57 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  35.21 
 
 		 74 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 813 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01890  DNA-binding protein, excisionase family  36.51 
 
 		 321 aa  47.4  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0766202 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0363  hypothetical protein  40.82 
 
 		 147 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  38.78 
 
 		 320 aa  47  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  37.5 
 
 		 75 aa  45.4  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0918  histidine kinase  28.97 
 
 		 443 aa  45.4  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  38.98 
 
 		 126 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1182  phage transcriptional regulator, AlpA  38.98 
 
 		 72 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1575  DNA binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.410844  hitchhiker  0.00561125 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 440 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 410 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1178  histidine kinase internal region  28.7 
 
 		 414 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 410 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0783  DNA binding domain protein, excisionase family  42.22 
 
 		 82 aa  43.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1062  DNA binding domain protein, excisionase family  39.68 
 
 		 291 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  37.25 
 
 		 73 aa  42.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1059  DNA binding domain protein, excisionase family  42.59 
 
 		 292 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1001  DNA-binding excisionase/Xis  41.51 
 
 		 290 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  34.04 
 
 		 90 aa  42  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2607  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  25.64 
 
 		 741 aa  42  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>