63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1738 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1738  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 272 aa  546  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2133  DNA binding domain-containing protein  84 
 
 		 252 aa  423  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 		 718 aa  65.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  32.76 
 
 		 1239 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 1279 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 1322 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.65 
 
 		 1079 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  34.03 
 
 		 571 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0700  DNA binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000271881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  40.51 
 
 		 719 aa  59.3  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  39.34 
 
 		 139 aa  52.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  47.06 
 
 		 56 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4254  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 62 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631275  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01890  DNA-binding protein, excisionase family  41.18 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0766202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 813 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.61 
 
 		 758 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0818  EAL and GGDEF domain-containing protein  35.66 
 
 		 976 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1575  DNA binding domain-containing protein  42.42 
 
 		 293 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.410844  hitchhiker  0.00561125 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0363  hypothetical protein  41.18 
 
 		 147 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  26.7 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1399  two component sensor histidine kinase  33.58 
 
 		 565 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  34.69 
 
 		 67 aa  47.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 440 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  26.25 
 
 		 414 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  42 
 
 		 57 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  41.51 
 
 		 80 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  30.21 
 
 		 320 aa  46.6  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  28.89 
 
 		 410 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2607  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  25.81 
 
 		 741 aa  46.2  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  27.82 
 
 		 410 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  39.58 
 
 		 90 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4598  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 76 aa  46.2  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  35.38 
 
 		 70 aa  45.8  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  38.18 
 
 		 82 aa  45.8  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  40.38 
 
 		 78 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0810  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 60 aa  45.8  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0378139 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 		 74 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  32.69 
 
 		 180 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  40 
 
 		 75 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1062  DNA binding domain protein, excisionase family  39.19 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  38 
 
 		 112 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  32.69 
 
 		 180 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  32.69 
 
 		 180 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  38 
 
 		 84 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  38 
 
 		 84 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  38 
 
 		 84 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  38 
 
 		 90 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0918  histidine kinase  29.91 
 
 		 443 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0783  DNA binding domain protein, excisionase family  47.37 
 
 		 82 aa  43.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1346  MerR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 156 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000136372  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  42 
 
 		 78 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  26.61 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  26.61 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  26.61 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  42 
 
 		 126 aa  42.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  26.61 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  26.61 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  33.9 
 
 		 84 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  34.62 
 
 		 73 aa  42.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  29.32 
 
 		 317 aa  42.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1059  DNA binding domain protein, excisionase family  42.19 
 
 		 292 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  26.4 
 
 		 304 aa  42  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>