40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0783 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0783  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 82 aa  167  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0700  DNA binding domain-containing protein  35.38 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000271881  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  30 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3952  DNA binding domain-containing protein  44.9 
 
 		 317 aa  48.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8921  DNA binding domain protein, excisionase family  44.9 
 
 		 57 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0131376  normal  0.135259 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  38.78 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  32.39 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  32.35 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  32.35 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  32.35 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4598  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  40.43 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  40.82 
 
 		 308 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  28.75 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  46.81 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1738  DNA binding domain-containing protein  47.37 
 
 		 272 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  40.82 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2133  DNA binding domain-containing protein  42.22 
 
 		 252 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1683  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.629523  decreased coverage  0.0000560234 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  43.48 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1068  DNA binding domain-containing protein  44 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  34.55 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  46.51 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  34.55 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  38.46 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  34.55 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0363  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  35.48 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3430  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1862  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382901  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  38.89 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  37.74 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  51.35 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  37.78 
 
 		 320 aa  41.2  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0405  excisionase/Xis, DNA-binding  57.89 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  36.92 
 
 		 126 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>