104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0661 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
80 aa  165  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  90.16 
 
 
82 aa  116  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  79.71 
 
 
84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  79.71 
 
 
84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  79.71 
 
 
84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  67.09 
 
 
90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  82.81 
 
 
90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  84.75 
 
 
78 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  65.33 
 
 
78 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  73.85 
 
 
67 aa  98.6  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  70.31 
 
 
67 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  81.82 
 
 
66 aa  95.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  80 
 
 
71 aa  94.7  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  70.31 
 
 
67 aa  95.1  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  80 
 
 
67 aa  94.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  80 
 
 
85 aa  93.6  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  68.25 
 
 
67 aa  92.8  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  61.73 
 
 
112 aa  92  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  76.79 
 
 
70 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  82.35 
 
 
69 aa  86.3  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  78.43 
 
 
74 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  80.39 
 
 
69 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  79.25 
 
 
69 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  73.08 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  67.27 
 
 
77 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  66.67 
 
 
70 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  76 
 
 
78 aa  78.2  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  61.54 
 
 
74 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  69.77 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  46.94 
 
 
317 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  47.92 
 
 
315 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4561  DNA binding domain protein, excisionase family  39.58 
 
 
335 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000373649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0019  DNA binding domain protein, excisionase family  51.11 
 
 
326 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  45.65 
 
 
308 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  45.65 
 
 
306 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  45.65 
 
 
315 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  45.65 
 
 
306 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  40.43 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  45.65 
 
 
306 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  45.65 
 
 
306 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  43.48 
 
 
315 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  43.48 
 
 
315 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  45.65 
 
 
305 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  43.48 
 
 
306 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  45.65 
 
 
306 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1923  phage transcriptional regulator, AlpA  38 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  45.65 
 
 
306 aa  47.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1068  DNA binding domain-containing protein  45.9 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18850  DNA-binding protein, excisionase family  32.79 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0755115 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0057  DNA binding domain protein, excisionase family  36 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1738  DNA binding domain-containing protein  41.51 
 
 
272 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  34.62 
 
 
180 aa  47  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  44.9 
 
 
320 aa  47  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0810  DNA binding domain-containing protein  31.37 
 
 
60 aa  46.2  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0378139 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  34.62 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0700  DNA binding domain-containing protein  42.55 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000271881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0830  DNA binding domain protein, excisionase family  55.26 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  29.09 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  34.62 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1818  DNA binding domain protein, excisionase family  38.18 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0783  DNA binding domain protein, excisionase family  32.39 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1014  DNA binding domain protein, excisionase family  35.85 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174874  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1182  phage transcriptional regulator, AlpA  36.73 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592067  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0399  DNA binding domain protein  40 
 
 
70 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  36 
 
 
57 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2433  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 
71 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0216773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2702  DNA binding domain-containing protein  37.5 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265646  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1057  phage transcriptional regulator, AlpA  40.74 
 
 
72 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0972147  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  36.73 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  36.73 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1172  phage transcriptional regulator, AlpA  32.69 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0403  DNA binding domain-containing protein  38.78 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00109148  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  32 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1600  excisionase/Xis, DNA-binding protein  42.31 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.607243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15570  hypothetical protein  34.69 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000408648  unclonable  2.14199e-22 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1213  DNA binding domain-containing protein  35.09 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134195  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2531  phage transcriptional regulator, AlpA  34.69 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  hitchhiker  0.000129846 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0183  excisionase/Xis, DNA-binding  38.64 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.50459 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0771  putative transcriptional regulator  33.96 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707589  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  36.54 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  34 
 
 
56 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0933  DNA binding domain protein  48.89 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0230  DNA binding domain-containing protein  35.29 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.016519 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0630  DNA binding domain protein, excisionase family  32.69 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1452  DNA binding domain protein, excisionase family  34.69 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  44.74 
 
 
64 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1754  DNA binding domain-containing protein  33.96 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.988357  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  44.74 
 
 
64 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5834  phage transcriptional regulator, AlpA  33.96 
 
 
78 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  28.3 
 
 
73 aa  41.2  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  44.74 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2286  DNA binding domain-containing protein  32.69 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5748  excisionase/Xis, DNA-binding  38.3 
 
 
165 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0250382  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1200  excisionase/Xis, DNA-binding  30.3 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00000791415  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4404  DNA binding domain-containing protein  36.11 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00533805  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0912  excision promoter, Xis  34.92 
 
 
76 aa  40.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.5021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1373  DNA binding domain protein, excisionase family  29.82 
 
 
76 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.150452  normal  0.608201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3803  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 
75 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0056722  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0880  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0183206  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1390  phage transcriptional regulator, AlpA  32.2 
 
 
70 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>