86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5764 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  100 
 
 		 69 aa  138  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  79.31 
 
 		 69 aa  93.6  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  75 
 
 		 78 aa  92  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  77.97 
 
 		 74 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  75.86 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  80 
 
 		 112 aa  90.1  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  71.88 
 
 		 66 aa  89.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  76.79 
 
 		 85 aa  88.6  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  76.79 
 
 		 67 aa  87.8  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  75 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  70.69 
 
 		 84 aa  85.9  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  68.25 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  75 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  73.21 
 
 		 67 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  74.55 
 
 		 71 aa  84.3  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  61.76 
 
 		 70 aa  83.6  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  79.25 
 
 		 80 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  67.86 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  73.08 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  74.07 
 
 		 82 aa  79.7  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  76.92 
 
 		 67 aa  79.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  58.06 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  70.37 
 
 		 84 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  70.37 
 
 		 84 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  70.37 
 
 		 84 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  69.09 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  67.86 
 
 		 78 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  68.75 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0057  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1068  DNA binding domain-containing protein  53.19 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0230  DNA binding domain-containing protein  37.74 
 
 		 59 aa  47.4  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.016519 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  39.62 
 
 		 308 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  44.23 
 
 		 315 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0830  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18850  DNA-binding protein, excisionase family  42.86 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0755115 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  40.38 
 
 		 317 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4561  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 335 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000373649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5521  DNA binding domain-containing protein  44.68 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00471418  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  39.66 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  39.66 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0475  DNA binding domain protein, excisionase family  33.96 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  38.3 
 
 		 180 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0405  excisionase/Xis, DNA-binding  41.3 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  46.15 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5325  DNA binding domain-containing protein  48.94 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0330031 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  36.36 
 
 		 320 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0700  DNA binding domain-containing protein  46.34 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000271881  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  38.3 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0183  excisionase/Xis, DNA-binding  37.25 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.50459 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  32.14 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  38.3 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1923  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151509  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  34.69 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  42.22 
 
 		 305 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  42.22 
 
 		 306 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  42.22 
 
 		 306 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  40 
 
 		 306 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3222  hypothetical protein  56.76 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0399  DNA binding domain protein  34.69 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  42.22 
 
 		 306 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0783  DNA binding domain protein, excisionase family  40.82 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  42.22 
 
 		 315 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1373  DNA binding domain protein, excisionase family  32.73 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.150452  normal  0.608201 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  42.22 
 
 		 306 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1359  hypothetical protein  36.21 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.303648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  40 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  40 
 
 		 315 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  35.42 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2059  excisionase/Xis, DNA-binding  36.54 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  42.22 
 
 		 306 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0403  DNA binding domain-containing protein  36 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00109148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1452  DNA binding domain protein, excisionase family  36 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4226  DNA binding domain-containing protein  53.33 
 
 		 110 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.89473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  36 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2463  DNA binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000388448  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0933  DNA binding domain protein  50 
 
 		 73 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  42.22 
 
 		 306 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1410  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  42.55 
 
 		 73 aa  41.2  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.251698  normal  0.111999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2702  DNA binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2433  DNA binding domain protein, excisionase family  33.9 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0216773 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01890  DNA-binding protein, excisionase family  46 
 
 		 321 aa  41.2  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0766202 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0019  DNA binding domain protein, excisionase family  46 
 
 		 326 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1790  DNA binding domain-containing protein  28.33 
 
 		 155 aa  40  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0748  excisionase/Xis, DNA-binding  28.57 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.613095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6248  hypothetical protein  47.06 
 
 		 161 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706336  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>