117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2705 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  100 
 
 		 77 aa  154  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  83.58 
 
 		 67 aa  110  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  71.64 
 
 		 67 aa  99.4  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  70.15 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  67.16 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  62.67 
 
 		 85 aa  94.7  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  61.64 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  69.35 
 
 		 74 aa  92  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  72.58 
 
 		 69 aa  90.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  64.06 
 
 		 70 aa  89.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 69 aa  88.6  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  71.93 
 
 		 66 aa  88.6  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  58.33 
 
 		 71 aa  84.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  62.12 
 
 		 70 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  71.7 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  56.72 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  67.86 
 
 		 69 aa  80.5  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  67.27 
 
 		 80 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  57.58 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  63.33 
 
 		 78 aa  79.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  57.58 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  57.58 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  55.07 
 
 		 78 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  64.29 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  51.85 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  54.17 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  65.38 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  54.72 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  48.98 
 
 		 317 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4561  DNA binding domain protein, excisionase family  45.83 
 
 		 335 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000373649  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18850  DNA-binding protein, excisionase family  44.07 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0755115 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0019  DNA binding domain protein, excisionase family  44.23 
 
 		 326 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  47.92 
 
 		 315 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  44 
 
 		 308 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  44.68 
 
 		 306 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  44.68 
 
 		 305 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  44.68 
 
 		 306 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 180 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 180 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  42.55 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 180 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  36 
 
 		 56 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1923  phage transcriptional regulator, AlpA  38.78 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0700  DNA binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000271881  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1818  DNA binding domain protein, excisionase family  41.18 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  42.55 
 
 		 306 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  42.55 
 
 		 315 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  34.04 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  42.55 
 
 		 306 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 57 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  42.55 
 
 		 306 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  42.55 
 
 		 306 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  40.43 
 
 		 315 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  40.43 
 
 		 306 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  40.43 
 
 		 315 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0057  DNA binding domain protein, excisionase family  38 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  34.69 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0279  DNA binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908043  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0912  excision promoter, Xis  38.71 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.5021 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0403  DNA binding domain-containing protein  42.22 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00109148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1014  DNA binding domain protein, excisionase family  38.46 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174874  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3430  putative transcriptional regulator  39.22 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1754  DNA binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.988357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0975  DNA binding domain-containing protein  37.1 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04063  VrlI like protein  38.78 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  29.41 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0771  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  39.53 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  39.53 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5834  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0399  DNA binding domain protein  44.19 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0230  DNA binding domain-containing protein  34.55 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.016519 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2760  putative transcriptional regulator  38.78 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466966 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0810  DNA binding domain-containing protein  32.65 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0378139 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  39.53 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  36.36 
 
 		 320 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0830  DNA binding domain protein, excisionase family  42.31 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0630  DNA binding domain protein, excisionase family  32.73 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01890  DNA-binding protein, excisionase family  44.9 
 
 		 321 aa  44.3  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0766202 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2195  phage transcriptional regulator, AlpA  38.78 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5521  DNA binding domain-containing protein  38.3 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00471418  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2286  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1862  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 71 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382901  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2321  DNA binding domain protein, excisionase family  35.71 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.842741  hitchhiker  0.0000766281 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2142  excisionase/Xis, DNA-binding  47.5 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.276898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2702  DNA binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265646  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0554  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1174  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2463  DNA binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000388448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3682  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  34.69 
 
 		 83 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0933  DNA binding domain protein  34.69 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0957  excision promoter, Xis  31.03 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.392434  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2433  DNA binding domain protein, excisionase family  36.84 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0216773 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0183  excisionase/Xis, DNA-binding  38 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.50459 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0405  excisionase/Xis, DNA-binding  39.62 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3844  phage transcriptional regulator, AlpA  39.66 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.279149 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1683  DNA binding domain protein, excisionase family  34.69 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.629523  decreased coverage  0.0000560234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4598  DNA binding domain protein, excisionase family  41.3 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>