24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4226 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_4226  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.89473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1068  DNA binding domain-containing protein  55.17 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3222  hypothetical protein  44.3 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  47.06 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  55.56 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  60.53 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  42.42 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  54.55 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  42.42 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  48.08 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0830  DNA binding domain protein, excisionase family  45.1 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  45.28 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  54.35 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  48.94 
 
 		 84 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  53.33 
 
 		 69 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  46.43 
 
 		 66 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  48.94 
 
 		 84 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  48.94 
 
 		 84 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  51.11 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  41.51 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  51.11 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  51.11 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  48.89 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>