130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3301 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 84 aa  170  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  84.29 
 
 		 70 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  71.19 
 
 		 74 aa  90.9  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  68.25 
 
 		 67 aa  90.9  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  59.15 
 
 		 85 aa  90.1  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  72.41 
 
 		 78 aa  89.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  62.5 
 
 		 66 aa  87.8  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  67.74 
 
 		 69 aa  87.8  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  67.8 
 
 		 74 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  70.69 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  75.47 
 
 		 71 aa  85.9  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  64.52 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  64.62 
 
 		 70 aa  84  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  66.67 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  75 
 
 		 82 aa  82  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  64.41 
 
 		 67 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  71.15 
 
 		 67 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  71.7 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  56.72 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  73.08 
 
 		 80 aa  80.5  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  71.43 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  76 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  76 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  66.07 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  57.63 
 
 		 75 aa  72  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  41.94 
 
 		 315 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  40.32 
 
 		 315 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  40.32 
 
 		 315 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0183  excisionase/Xis, DNA-binding  37.93 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.50459 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  42.37 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  46.81 
 
 		 317 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  42.37 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0830  DNA binding domain protein, excisionase family  49.09 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  47.83 
 
 		 306 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  47.83 
 
 		 306 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  47.83 
 
 		 306 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  47.83 
 
 		 306 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 315 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  43.14 
 
 		 305 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  45.65 
 
 		 306 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1923  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151509  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  40.68 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 306 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  35.19 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0399  DNA binding domain protein  45.45 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  45.65 
 
 		 306 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  35.19 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15570  hypothetical protein  31.75 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000408648  unclonable  2.14199e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2531  phage transcriptional regulator, AlpA  31.75 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  hitchhiker  0.000129846 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  42.22 
 
 		 308 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0230  DNA binding domain-containing protein  36.54 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.016519 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  35 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4561  DNA binding domain protein, excisionase family  38.46 
 
 		 335 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000373649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1452  DNA binding domain protein, excisionase family  35 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5521  DNA binding domain-containing protein  44.68 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00471418  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0019  DNA binding domain protein, excisionase family  46.81 
 
 		 326 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0405  excisionase/Xis, DNA-binding  42.55 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1172  phage transcriptional regulator, AlpA  32.14 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5325  DNA binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0330031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5834  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0403  DNA binding domain-containing protein  38.3 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00109148  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04063  VrlI like protein  38.33 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18850  DNA-binding protein, excisionase family  35.71 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0755115 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  32.14 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3430  putative transcriptional regulator  32.43 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3757  excisionase/Xis, DNA-binding  36.17 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0177  hypothetical protein  38.78 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.102723  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1754  DNA binding domain-containing protein  39.62 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.988357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1068  DNA binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2501  Prophage CP4-57 regulatory  39.62 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  37.74 
 
 		 320 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  34 
 
 		 248 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2760  putative transcriptional regulator  37.7 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 57 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0933  DNA binding domain protein  44.68 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0771  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1600  excisionase/Xis, DNA-binding protein  40 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.607243  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4404  DNA binding domain-containing protein  42.59 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00533805  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2321  DNA binding domain protein, excisionase family  35.48 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.842741  hitchhiker  0.0000766281 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0554  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1818  DNA binding domain protein, excisionase family  37.74 
 
 		 71 aa  44.3  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1373  DNA binding domain protein, excisionase family  37.74 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.150452  normal  0.608201 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0810  DNA binding domain-containing protein  30.61 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0378139 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3682  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  32.14 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01890  DNA-binding protein, excisionase family  44.9 
 
 		 321 aa  43.9  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0766202 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0630  DNA binding domain protein, excisionase family  30.91 
 
 		 93 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0475  DNA binding domain protein, excisionase family  34.78 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  29.41 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1862  putative transcriptional regulator  31.67 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382901  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2702  DNA binding domain-containing protein  42 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265646  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2195  phage transcriptional regulator, AlpA  32.31 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0565  hypothetical protein  42.86 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.978758  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2286  DNA binding domain-containing protein  31.48 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2433  DNA binding domain protein, excisionase family  41.18 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0216773 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>