58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0771 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0771  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 78 aa  161  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5834  phage transcriptional regulator, AlpA  93.59 
 
 		 78 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1818  DNA binding domain protein, excisionase family  69.57 
 
 		 71 aa  103  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1754  DNA binding domain-containing protein  74.63 
 
 		 79 aa  102  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.988357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08700  DNA-binding protein, excisionase family  65.79 
 
 		 76 aa  97.4  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.687814 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1213  DNA binding domain-containing protein  61.33 
 
 		 81 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134195  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0975  DNA binding domain-containing protein  65.71 
 
 		 76 aa  95.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20560  hypothetical protein  73.33 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0912  excision promoter, Xis  61.97 
 
 		 76 aa  92  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.5021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1373  DNA binding domain protein, excisionase family  60.87 
 
 		 76 aa  90.9  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.150452  normal  0.608201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3803  putative transcriptional regulator  67.16 
 
 		 75 aa  90.9  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0056722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2321  DNA binding domain protein, excisionase family  69.35 
 
 		 74 aa  90.5  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.842741  hitchhiker  0.0000766281 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2501  Prophage CP4-57 regulatory  61.19 
 
 		 69 aa  82.8  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4273  DNA binding domain protein, excisionase family  57.89 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1256  DNA binding domain protein, excisionase family  65.45 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0879674 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14660  DNA-binding protein, excisionase family  62.3 
 
 		 74 aa  77  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2702  DNA binding domain-containing protein  64.81 
 
 		 71 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2433  DNA binding domain protein, excisionase family  64.81 
 
 		 71 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0216773 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4404  DNA binding domain-containing protein  48 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00533805  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4229  DNA binding domain-containing protein  45.33 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000299969  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4635  DNA binding domain protein, excisionase family  40.79 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  38.98 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  42.59 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0344  DNA binding domain protein, excisionase family  38.18 
 
 		 56 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  41.18 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  36.36 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 57 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  37.04 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  38.89 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  37.04 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  30.36 
 
 		 67 aa  43.9  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  37.04 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  38.89 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  35.09 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  37.04 
 
 		 71 aa  42.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  33.96 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0057  hypothetical protein  39.62 
 
 		 333 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.027225  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  37.04 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  43.14 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5607  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 333 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4561  DNA binding domain protein, excisionase family  37.93 
 
 		 335 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000373649  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6523  prophage CP4-57 regulatory  45.83 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1532  DNA binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000035753  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  38.89 
 
 		 317 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1923  phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151509  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  40.38 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1182  phage transcriptional regulator, AlpA  40.38 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  35.85 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  36.36 
 
 		 320 aa  40.8  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1759  hypothetical protein  35.82 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>