25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1256 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1256  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 69 aa  140  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0879674 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2321  DNA binding domain protein, excisionase family  69.09 
 
 		 74 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.842741  hitchhiker  0.0000766281 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2702  DNA binding domain-containing protein  65 
 
 		 71 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265646  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20560  hypothetical protein  64.29 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5834  phage transcriptional regulator, AlpA  69.09 
 
 		 78 aa  80.1  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1818  DNA binding domain protein, excisionase family  64.91 
 
 		 71 aa  80.5  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2433  DNA binding domain protein, excisionase family  66.07 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0216773 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0771  putative transcriptional regulator  65.45 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1213  DNA binding domain-containing protein  61.82 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134195  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1373  DNA binding domain protein, excisionase family  63.64 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.150452  normal  0.608201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3803  putative transcriptional regulator  64.91 
 
 		 75 aa  76.6  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0056722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14660  DNA-binding protein, excisionase family  56.45 
 
 		 74 aa  73.6  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08700  DNA-binding protein, excisionase family  56.52 
 
 		 76 aa  72.8  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.687814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4273  DNA binding domain protein, excisionase family  60 
 
 		 91 aa  72  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2501  Prophage CP4-57 regulatory  54.69 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4635  DNA binding domain protein, excisionase family  53.97 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1754  DNA binding domain-containing protein  60 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.988357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0975  DNA binding domain-containing protein  56.36 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0912  excision promoter, Xis  56.36 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.5021 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4404  DNA binding domain-containing protein  50 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00533805  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4229  DNA binding domain-containing protein  50 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000299969  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1790  DNA binding domain-containing protein  34.92 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  37.5 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  32.79 
 
 		 74 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>