33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08700 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_08700  DNA-binding protein, excisionase family  100 
 
 		 76 aa  152  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.687814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5834  phage transcriptional regulator, AlpA  71.62 
 
 		 78 aa  100  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0771  putative transcriptional regulator  65.79 
 
 		 78 aa  97.4  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1818  DNA binding domain protein, excisionase family  70.31 
 
 		 71 aa  97.1  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20560  hypothetical protein  73.85 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2321  DNA binding domain protein, excisionase family  72.58 
 
 		 74 aa  94  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.842741  hitchhiker  0.0000766281 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1754  DNA binding domain-containing protein  72.58 
 
 		 79 aa  93.6  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.988357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3803  putative transcriptional regulator  73.44 
 
 		 75 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0056722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1213  DNA binding domain-containing protein  62.9 
 
 		 81 aa  87.4  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134195  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2501  Prophage CP4-57 regulatory  63.64 
 
 		 69 aa  84  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14660  DNA-binding protein, excisionase family  64.52 
 
 		 74 aa  82.8  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4273  DNA binding domain protein, excisionase family  64.06 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0975  DNA binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 76 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2702  DNA binding domain-containing protein  57.35 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2433  DNA binding domain protein, excisionase family  57.35 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0216773 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1373  DNA binding domain protein, excisionase family  61.02 
 
 		 76 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.150452  normal  0.608201 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0912  excision promoter, Xis  63.16 
 
 		 76 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.5021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1256  DNA binding domain protein, excisionase family  56.52 
 
 		 69 aa  72.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0879674 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4404  DNA binding domain-containing protein  44.93 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00533805  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4229  DNA binding domain-containing protein  47.37 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000299969  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4635  DNA binding domain protein, excisionase family  44.07 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1759  hypothetical protein  46.43 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  38.18 
 
 		 57 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  41.07 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1600  excisionase/Xis, DNA-binding protein  43.14 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.607243  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  39.29 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  32.86 
 
 		 308 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  35.71 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  31.48 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  39.22 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  35.85 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1923  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>