23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4273 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4273  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 91 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1213  DNA binding domain-containing protein  58.75 
 
 		 81 aa  88.2  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134195  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2321  DNA binding domain protein, excisionase family  73.33 
 
 		 74 aa  87  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.842741  hitchhiker  0.0000766281 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1818  DNA binding domain protein, excisionase family  68.85 
 
 		 71 aa  87  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08700  DNA-binding protein, excisionase family  64.06 
 
 		 76 aa  82.8  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.687814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5834  phage transcriptional regulator, AlpA  69.49 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0771  putative transcriptional regulator  57.89 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1754  DNA binding domain-containing protein  68.97 
 
 		 79 aa  78.6  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.988357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20560  hypothetical protein  65.52 
 
 		 79 aa  76.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1373  DNA binding domain protein, excisionase family  63.79 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.150452  normal  0.608201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3803  putative transcriptional regulator  55.26 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0056722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2433  DNA binding domain protein, excisionase family  64.41 
 
 		 71 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0216773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2702  DNA binding domain-containing protein  64.41 
 
 		 71 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265646  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0975  DNA binding domain-containing protein  63.93 
 
 		 76 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0912  excision promoter, Xis  54.55 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.5021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1256  DNA binding domain protein, excisionase family  60 
 
 		 69 aa  72  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0879674 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2501  Prophage CP4-57 regulatory  62.07 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14660  DNA-binding protein, excisionase family  52.7 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4229  DNA binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000299969  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4404  DNA binding domain-containing protein  46.58 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00533805  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4635  DNA binding domain protein, excisionase family  44.16 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2059  excisionase/Xis, DNA-binding  36.67 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0230  DNA binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.016519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>