50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0975 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0975  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 76 aa  157  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0912  excision promoter, Xis  93.42 
 
 		 76 aa  147  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.5021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0771  putative transcriptional regulator  65.71 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1213  DNA binding domain-containing protein  60.81 
 
 		 81 aa  94.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134195  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5834  phage transcriptional regulator, AlpA  64.29 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1754  DNA binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 79 aa  87.8  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.988357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1373  DNA binding domain protein, excisionase family  57.97 
 
 		 76 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.150452  normal  0.608201 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08700  DNA-binding protein, excisionase family  66.67 
 
 		 76 aa  82.4  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.687814 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1818  DNA binding domain protein, excisionase family  63.79 
 
 		 71 aa  82.4  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20560  hypothetical protein  57.14 
 
 		 79 aa  80.1  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2321  DNA binding domain protein, excisionase family  63.79 
 
 		 74 aa  79  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.842741  hitchhiker  0.0000766281 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2433  DNA binding domain protein, excisionase family  53.12 
 
 		 71 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0216773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2702  DNA binding domain-containing protein  58.62 
 
 		 71 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265646  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3803  putative transcriptional regulator  59.02 
 
 		 75 aa  76.6  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0056722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2501  Prophage CP4-57 regulatory  61.67 
 
 		 69 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4273  DNA binding domain protein, excisionase family  63.93 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14660  DNA-binding protein, excisionase family  50 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4229  DNA binding domain-containing protein  51.61 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000299969  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1256  DNA binding domain protein, excisionase family  56.36 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0879674 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4404  DNA binding domain-containing protein  54.24 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00533805  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4635  DNA binding domain protein, excisionase family  44.26 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  37.1 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  38.71 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  36.23 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  37.1 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  38.71 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  37.1 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  37.1 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  37.93 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  35.09 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  37.1 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  35.48 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  38.33 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  36.67 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  36.21 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  38.71 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  38.1 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2531  phage transcriptional regulator, AlpA  34.48 
 
 		 66 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  hitchhiker  0.000129846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15570  hypothetical protein  34.48 
 
 		 66 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000408648  unclonable  2.14199e-22 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1532  DNA binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000035753  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  35.19 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  34.48 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1057  phage transcriptional regulator, AlpA  41.3 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0972147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  35.85 
 
 		 56 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  33.87 
 
 		 308 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  35.19 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  33.93 
 
 		 74 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>