18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1057 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1057  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 72 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0972147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  40.74 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  43.4 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  40.74 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  38.46 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4404  DNA binding domain-containing protein  36.76 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00533805  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  37.7 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  38.33 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  38.18 
 
 		 90 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  38.18 
 
 		 84 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  38.18 
 
 		 84 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  38.18 
 
 		 84 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  41.82 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  41.82 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0975  DNA binding domain-containing protein  41.3 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  35.48 
 
 		 78 aa  40.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1818  DNA binding domain protein, excisionase family  37.7 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>