30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4404 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008537  Arth_4404  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 96 aa  197  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00533805  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4229  DNA binding domain-containing protein  69.79 
 
 		 96 aa  137  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000299969  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4635  DNA binding domain protein, excisionase family  51.02 
 
 		 98 aa  91.3  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2501  Prophage CP4-57 regulatory  55.22 
 
 		 69 aa  77.4  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1818  DNA binding domain protein, excisionase family  50.72 
 
 		 71 aa  75.1  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5834  phage transcriptional regulator, AlpA  49.33 
 
 		 78 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0771  putative transcriptional regulator  48 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2321  DNA binding domain protein, excisionase family  54.55 
 
 		 74 aa  69.3  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.842741  hitchhiker  0.0000766281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1373  DNA binding domain protein, excisionase family  54.1 
 
 		 76 aa  67  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.150452  normal  0.608201 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1754  DNA binding domain-containing protein  54.84 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.988357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1213  DNA binding domain-containing protein  54.39 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134195  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3803  putative transcriptional regulator  45.33 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0056722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0975  DNA binding domain-containing protein  54.24 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0912  excision promoter, Xis  52.54 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.5021 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2433  DNA binding domain protein, excisionase family  52.38 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0216773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2702  DNA binding domain-containing protein  55.17 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265646  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1256  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0879674 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08700  DNA-binding protein, excisionase family  44.93 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.687814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4273  DNA binding domain protein, excisionase family  46.58 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20560  hypothetical protein  46.55 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14660  DNA-binding protein, excisionase family  52.83 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  40.74 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  42.59 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1057  phage transcriptional regulator, AlpA  36.76 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0972147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6523  prophage CP4-57 regulatory  42.86 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  29.73 
 
 		 248 aa  41.6  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  33.78 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  38.18 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  36.11 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0522  phage transcriptional regulator  28.77 
 
 		 73 aa  40.4  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.527959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>