59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2321 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2321  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
74 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.842741  hitchhiker  0.0000766281 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1818  DNA binding domain protein, excisionase family  69.01 
 
 
71 aa  105  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1213  DNA binding domain-containing protein  76.27 
 
 
81 aa  99  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134195  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08700  DNA-binding protein, excisionase family  72.58 
 
 
76 aa  94  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.687814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5834  phage transcriptional regulator, AlpA  74.19 
 
 
78 aa  94  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2501  Prophage CP4-57 regulatory  68.12 
 
 
69 aa  90.9  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0771  putative transcriptional regulator  69.35 
 
 
78 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707589  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1373  DNA binding domain protein, excisionase family  74.58 
 
 
76 aa  90.5  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.150452  normal  0.608201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3803  putative transcriptional regulator  68.85 
 
 
75 aa  87  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0056722  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4273  DNA binding domain protein, excisionase family  73.33 
 
 
91 aa  87  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1754  DNA binding domain-containing protein  72.41 
 
 
79 aa  85.9  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.988357  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2433  DNA binding domain protein, excisionase family  71.93 
 
 
71 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0216773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2702  DNA binding domain-containing protein  71.93 
 
 
71 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265646  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20560  hypothetical protein  65 
 
 
79 aa  84  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1256  DNA binding domain protein, excisionase family  69.09 
 
 
69 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0879674 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14660  DNA-binding protein, excisionase family  65.57 
 
 
74 aa  80.1  0.000000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0975  DNA binding domain-containing protein  63.79 
 
 
76 aa  79  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339599  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4635  DNA binding domain protein, excisionase family  55.07 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0912  excision promoter, Xis  60.34 
 
 
76 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.5021 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4229  DNA binding domain-containing protein  51.39 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000299969  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4404  DNA binding domain-containing protein  54.55 
 
 
96 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00533805  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  37.5 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  42.31 
 
 
75 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 
57 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  33.33 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  37.04 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  35.48 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  35.19 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  35.71 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  30.36 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1600  excisionase/Xis, DNA-binding protein  44.9 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.607243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  36.54 
 
 
308 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  37.5 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  36.54 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  36.21 
 
 
90 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  41.51 
 
 
315 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  38 
 
 
306 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  35.09 
 
 
69 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  35.19 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  35.19 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  35.19 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  33.93 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  35.19 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1923  phage transcriptional regulator, AlpA  42 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  38 
 
 
315 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  35.71 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  38 
 
 
315 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  36 
 
 
306 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  36 
 
 
306 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  36 
 
 
315 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  36 
 
 
306 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  35.19 
 
 
71 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4026  putative prophage LambdaBa02, DNA-binding protein  40 
 
 
66 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.583083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4124  prophage LambdaBa02, DNA-binding protein  42.31 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.834337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3829  prophage LambdaBa02, DNA-binding protein  42.31 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00682736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>