55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1754 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1754  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 79 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.988357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5834  phage transcriptional regulator, AlpA  76.12 
 
 		 78 aa  104  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0771  putative transcriptional regulator  74.63 
 
 		 78 aa  102  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1213  DNA binding domain-containing protein  65.71 
 
 		 81 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134195  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08700  DNA-binding protein, excisionase family  72.58 
 
 		 76 aa  93.6  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.687814 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1818  DNA binding domain protein, excisionase family  66.67 
 
 		 71 aa  92.8  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0975  DNA binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 76 aa  87.8  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2321  DNA binding domain protein, excisionase family  72.41 
 
 		 74 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.842741  hitchhiker  0.0000766281 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0912  excision promoter, Xis  62.69 
 
 		 76 aa  84.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.5021 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2501  Prophage CP4-57 regulatory  66.67 
 
 		 69 aa  84  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3803  putative transcriptional regulator  68.85 
 
 		 75 aa  82.8  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0056722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20560  hypothetical protein  70.18 
 
 		 79 aa  83.2  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1373  DNA binding domain protein, excisionase family  61.54 
 
 		 76 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.150452  normal  0.608201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4273  DNA binding domain protein, excisionase family  68.97 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2433  DNA binding domain protein, excisionase family  66.67 
 
 		 71 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0216773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2702  DNA binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 71 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265646  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14660  DNA-binding protein, excisionase family  62.71 
 
 		 74 aa  73.9  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1256  DNA binding domain protein, excisionase family  60 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0879674 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4404  DNA binding domain-containing protein  54.84 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00533805  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4229  DNA binding domain-containing protein  51.39 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000299969  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4635  DNA binding domain protein, excisionase family  46.88 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  42.59 
 
 		 74 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  44.44 
 
 		 67 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 		 67 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  40.74 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  42.59 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  39.29 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  38.89 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  40.74 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  37.74 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  36.84 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  39.62 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  38.89 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  35.09 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  35.19 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  39.62 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  39.22 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1759  hypothetical protein  42.59 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  38.18 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  35.59 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  33.96 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  32.76 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  32.76 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1600  excisionase/Xis, DNA-binding protein  41.82 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.607243  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  36.54 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  32.76 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1532  DNA binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 201 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000035753  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  31.03 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0810  DNA binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 60 aa  40  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0378139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>