65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0230 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0230  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 
59 aa  117  7e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.016519 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4561  DNA binding domain protein, excisionase family  50.98 
 
 
335 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000373649  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  38.6 
 
 
74 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0933  DNA binding domain protein  44.07 
 
 
73 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  38.6 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0277  DNA binding domain-containing protein  46.15 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.830937  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  38.46 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  38.89 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  42.59 
 
 
308 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  37.74 
 
 
69 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  44.23 
 
 
315 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  44.23 
 
 
306 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  44.23 
 
 
315 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  44.23 
 
 
315 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  44.23 
 
 
306 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  44.23 
 
 
306 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  44.23 
 
 
306 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  35.85 
 
 
71 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2705  DNA binding domain protein, excisionase family  41.18 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  44.23 
 
 
306 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  44.23 
 
 
306 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  40.35 
 
 
317 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3757  excisionase/Xis, DNA-binding  40.74 
 
 
58 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  42.86 
 
 
305 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  35.19 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2684  excisionase/Xis, DNA-binding  51.92 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  34.55 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  40.91 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  44.23 
 
 
306 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  40.35 
 
 
315 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  40.91 
 
 
90 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  42.86 
 
 
90 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2425  DNA binding domain-containing protein  46.81 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  42.86 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0399  DNA binding domain protein  33.33 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  33.96 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  42.86 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  42.86 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  32.08 
 
 
74 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0957  excision promoter, Xis  40.82 
 
 
69 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.392434  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  35.09 
 
 
320 aa  43.5  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1370  DNA binding domain protein, excisionase family  47.83 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2421  DNA binding domain-containing protein  46.81 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00439934  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1809  excisionase/Xis, DNA-binding  46.81 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2049  DNA binding domain-containing protein  50 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.531029  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  32.08 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  32.73 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5748  excisionase/Xis, DNA-binding  46.81 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0250382  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  35.29 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  38.89 
 
 
206 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  33.96 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0343  DNA binding domain protein, excisionase family  40.82 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1790  DNA binding domain-containing protein  38.18 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  30.91 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  42.86 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  32.08 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0748  excisionase/Xis, DNA-binding  38.89 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.613095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  32.08 
 
 
67 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  32.08 
 
 
69 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  32.08 
 
 
67 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04063  VrlI like protein  35.9 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4273  DNA binding domain protein, excisionase family  32.14 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1273  DNA binding domain protein, excisionase family  38.98 
 
 
79 aa  40.4  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.33756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>