21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0277 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0277  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 110 aa  218  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.830937  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2049  DNA binding domain-containing protein  49.06 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.531029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1370  DNA binding domain protein, excisionase family  49.02 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0230  DNA binding domain-containing protein  46.15 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.016519 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1790  DNA binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0399  DNA binding domain protein  44.23 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1809  excisionase/Xis, DNA-binding  52.17 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2421  DNA binding domain-containing protein  52.17 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00439934  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  27.59 
 
 		 320 aa  43.5  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2684  excisionase/Xis, DNA-binding  41.18 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2425  DNA binding domain-containing protein  52.17 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0059  DNA binding domain-containing protein  42.31 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4561  DNA binding domain protein, excisionase family  41.51 
 
 		 335 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000373649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1245  hypothetical protein  40.68 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  36 
 
 		 317 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0748  excisionase/Xis, DNA-binding  38 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.613095 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  35.09 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  38 
 
 		 315 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2059  excisionase/Xis, DNA-binding  37.5 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1273  DNA binding domain protein, excisionase family  41.18 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.33756  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2350  DNA binding domain protein, excisionase family  40.82 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.110873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>