25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2684 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2684  excisionase/Xis, DNA-binding  100 
 
 		 95 aa  190  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2049  DNA binding domain-containing protein  69.47 
 
 		 95 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.531029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1370  DNA binding domain protein, excisionase family  68.37 
 
 		 94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1790  DNA binding domain-containing protein  40 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3757  excisionase/Xis, DNA-binding  48 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1809  excisionase/Xis, DNA-binding  52.27 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2421  DNA binding domain-containing protein  52.27 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00439934  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3029  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.029266 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2425  DNA binding domain-containing protein  52.27 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0230  DNA binding domain-containing protein  51.92 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.016519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1508  DNA binding domain-containing protein  40 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000123588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4091  DNA binding domain protein, excisionase family  42 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3544  phage excisionase  42.22 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5748  excisionase/Xis, DNA-binding  47.73 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0933  DNA binding domain protein  44 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0399  DNA binding domain protein  40.74 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0277  DNA binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.830937  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0700  DNA binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000271881  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1273  DNA binding domain protein, excisionase family  51.22 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.33756  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2059  excisionase/Xis, DNA-binding  37.88 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0748  excisionase/Xis, DNA-binding  36.73 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.613095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4329  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0181935  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0893  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  37.68 
 
 		 230 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4561  DNA binding domain protein, excisionase family  34.21 
 
 		 335 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000373649  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2507  DNA binding domain protein, excisionase family  32.43 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.286901  normal  0.381075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>