19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2049 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2049  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 95 aa  191  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.531029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1370  DNA binding domain protein, excisionase family  73.96 
 
 		 94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2684  excisionase/Xis, DNA-binding  69.47 
 
 		 95 aa  120  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1790  DNA binding domain-containing protein  30 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0277  DNA binding domain-containing protein  49.06 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.830937  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3029  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.029266 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3757  excisionase/Xis, DNA-binding  42 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1809  excisionase/Xis, DNA-binding  50 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2421  DNA binding domain-containing protein  50 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00439934  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1508  DNA binding domain-containing protein  32.22 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000123588 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2425  DNA binding domain-containing protein  50 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0230  DNA binding domain-containing protein  50 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.016519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4091  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5748  excisionase/Xis, DNA-binding  47.73 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0933  DNA binding domain protein  44 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3544  phage excisionase  42.22 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1273  DNA binding domain protein, excisionase family  53.66 
 
 		 79 aa  40  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.33756  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0399  DNA binding domain protein  42 
 
 		 70 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3779  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  41.54 
 
 		 232 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00106137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>