30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3544 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3544  phage excisionase  100 
 
 
149 aa  286  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374064  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4091  DNA binding domain protein, excisionase family  72 
 
 
151 aa  201  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1508  DNA binding domain-containing protein  54.68 
 
 
140 aa  139  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000123588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3029  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 
137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.029266 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1790  DNA binding domain-containing protein  26 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5748  excisionase/Xis, DNA-binding  33.09 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0250382  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1809  excisionase/Xis, DNA-binding  34.56 
 
 
137 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2421  DNA binding domain-containing protein  34.56 
 
 
137 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00439934  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2425  DNA binding domain-containing protein  34.56 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0363  hypothetical protein  41.3 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  33.73 
 
 
206 aa  47  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1370  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0399  DNA binding domain protein  47.73 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2684  excisionase/Xis, DNA-binding  42.22 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0343  DNA binding domain protein, excisionase family  40.43 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1346  MerR family transcriptional regulator  22.31 
 
 
156 aa  42  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000136372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0700  DNA binding domain-containing protein  38.64 
 
 
144 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000271881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  39.34 
 
 
315 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  37.7 
 
 
306 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  37.7 
 
 
315 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  37.7 
 
 
306 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  37.7 
 
 
306 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  39.34 
 
 
315 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1829  DNA binding domain-containing protein  40.48 
 
 
109 aa  40.4  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0933  DNA binding domain protein  33.33 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2049  DNA binding domain-containing protein  42.22 
 
 
95 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.531029  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  33.33 
 
 
306 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  33.33 
 
 
306 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  39.34 
 
 
306 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  44.9 
 
 
248 aa  40.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>