54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2677 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 248 aa  502  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2531  phage transcriptional regulator, AlpA  42.59 
 
 		 66 aa  52.4  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  hitchhiker  0.000129846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15570  hypothetical protein  42.59 
 
 		 66 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000408648  unclonable  2.14199e-22 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  49.02 
 
 		 126 aa  52  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1182  phage transcriptional regulator, AlpA  49.02 
 
 		 72 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  36.36 
 
 		 676 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  35.19 
 
 		 67 aa  50.4  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  40.74 
 
 		 75 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0554  phage transcriptional regulator, AlpA  30.77 
 
 		 69 aa  49.3  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0810  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 60 aa  48.9  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0378139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4598  DNA binding domain protein, excisionase family  42.59 
 
 		 76 aa  48.9  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0403  DNA binding domain-containing protein  50 
 
 		 118 aa  48.9  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00109148  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1829  DNA binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 109 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3430  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 84 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0399  DNA binding domain protein  41.54 
 
 		 70 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  42.59 
 
 		 74 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0533  DNA binding domain, excisionase family  36.84 
 
 		 61 aa  47.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097622 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 180 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 180 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1468  excisionase/Xis, DNA-binding  32.84 
 
 		 78 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118441  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 180 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3757  excisionase/Xis, DNA-binding  42.86 
 
 		 58 aa  46.6  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3682  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  34.04 
 
 		 83 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1172  phage transcriptional regulator, AlpA  35 
 
 		 93 aa  46.2  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4864  DNA binding domain-containing protein  40.35 
 
 		 274 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.68065  normal  0.158916 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2195  phage transcriptional regulator, AlpA  36.17 
 
 		 70 aa  46.2  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  38.89 
 
 		 73 aa  46.2  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  37.29 
 
 		 74 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2760  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 67 aa  46.2  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466966 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  34 
 
 		 84 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0720  DNA binding domain-containing protein  43.14 
 
 		 129 aa  45.4  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.60238  normal  0.0504983 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04063  VrlI like protein  34.04 
 
 		 65 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  42.86 
 
 		 56 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4254  phage transcriptional regulator, AlpA  43.75 
 
 		 62 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1068  DNA binding domain-containing protein  47.92 
 
 		 117 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0630  DNA binding domain protein, excisionase family  31.58 
 
 		 93 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5748  excisionase/Xis, DNA-binding  26.26 
 
 		 165 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 57 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2286  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 93 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 67 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2507  DNA binding domain protein, excisionase family  44 
 
 		 100 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.286901  normal  0.381075 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  35.19 
 
 		 70 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1738  DNA binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1174  phage transcriptional regulator, AlpA  32.61 
 
 		 65 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 90 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3844  phage transcriptional regulator, AlpA  29.63 
 
 		 74 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.279149 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1532  DNA binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000035753  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1862  putative transcriptional regulator  26.79 
 
 		 71 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3029  DNA binding domain protein, excisionase family  36.36 
 
 		 137 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.029266 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  39.58 
 
 		 206 aa  42.4  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0279  DNA binding domain-containing protein  29.87 
 
 		 89 aa  42.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908043  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 66 aa  42  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1273  DNA binding domain protein, excisionase family  38.46 
 
 		 79 aa  42  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.33756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  31.65 
 
 		 315 aa  42  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>