46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1790 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1790  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 155 aa  314  3e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3029  DNA binding domain protein, excisionase family  30.07 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.029266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4091  DNA binding domain protein, excisionase family  25 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1508  DNA binding domain-containing protein  24.82 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000123588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3544  phage excisionase  26 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1346  MerR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000136372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2425  DNA binding domain-containing protein  21.62 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1809  excisionase/Xis, DNA-binding  20.95 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2421  DNA binding domain-containing protein  20.95 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00439934  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5748  excisionase/Xis, DNA-binding  20.95 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0363  hypothetical protein  46.67 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2059  excisionase/Xis, DNA-binding  43.33 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2684  excisionase/Xis, DNA-binding  40 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2049  DNA binding domain-containing protein  30 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.531029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2507  DNA binding domain protein, excisionase family  41.18 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.286901  normal  0.381075 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1370  DNA binding domain protein, excisionase family  36 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  31.71 
 
 		 308 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0748  excisionase/Xis, DNA-binding  40.82 
 
 		 104 aa  48.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.613095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0277  DNA binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 110 aa  48.5  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.830937  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0720  DNA binding domain-containing protein  28 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.60238  normal  0.0504983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0399  DNA binding domain protein  29.79 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  40.38 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0933  DNA binding domain protein  35.59 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0343  DNA binding domain protein, excisionase family  34.48 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3757  excisionase/Xis, DNA-binding  34.04 
 
 		 58 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1256  DNA binding domain protein, excisionase family  34.92 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0879674 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1062  DNA binding domain protein, excisionase family  30.26 
 
 		 291 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4635  DNA binding domain protein, excisionase family  32.73 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2705  DNA binding domain protein, excisionase family  37.74 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  29.41 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0230  DNA binding domain-containing protein  38.18 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.016519 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0403  DNA binding domain-containing protein  20.54 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00109148  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0700  DNA binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000271881  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  36.36 
 
 		 56 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  31.67 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5834  phage transcriptional regulator, AlpA  31.17 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  31.37 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  36.54 
 
 		 315 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1059  DNA binding domain protein, excisionase family  35.19 
 
 		 292 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  28.3 
 
 		 66 aa  41.2  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1536  DNA binding domain-containing protein  36.21 
 
 		 76 aa  41.2  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20560  hypothetical protein  33.93 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1001  DNA-binding excisionase/Xis  40.43 
 
 		 290 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  26.42 
 
 		 74 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  28.33 
 
 		 69 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>