21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1536 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1536  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 76 aa  150  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1923  phage transcriptional regulator, AlpA  47.27 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151509  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0475  DNA binding domain protein, excisionase family  42.59 
 
 		 59 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  48.15 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  46.3 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  46.3 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0405  excisionase/Xis, DNA-binding  46.3 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0173  DNA binding domain protein, excisionase family  43.33 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4535  DNA binding domain protein, excisionase family  38.89 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01990  DNA-binding protein, excisionase family  43.48 
 
 		 315 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000725149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0663  DNA binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.292535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5325  DNA binding domain-containing protein  46.51 
 
 		 61 aa  42.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0330031 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1600  excisionase/Xis, DNA-binding protein  43.4 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.607243  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1996  hypothetical protein  37.25 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.327621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0643  DNA binding domain protein, excisionase family  37.04 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7036  hypothetical protein  36.36 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5521  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00471418  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 74 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2977  DNA binding domain protein, excisionase family  39.62 
 
 		 98 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.467459  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1790  DNA binding domain-containing protein  36.21 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  38.3 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>