69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0405 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0405  excisionase/Xis, DNA-binding  100 
 
 		 63 aa  124  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  73.44 
 
 		 64 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  75 
 
 		 64 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  73.44 
 
 		 64 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5521  DNA binding domain-containing protein  69.84 
 
 		 65 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00471418  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5325  DNA binding domain-containing protein  68.25 
 
 		 61 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0330031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0475  DNA binding domain protein, excisionase family  46.3 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0643  DNA binding domain protein, excisionase family  56.6 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1536  DNA binding domain-containing protein  46.3 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4561  DNA binding domain protein, excisionase family  38.6 
 
 		 335 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000373649  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4535  DNA binding domain protein, excisionase family  45 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0262  hypothetical protein  47.17 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  44.68 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  42.31 
 
 		 317 aa  47.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  46.51 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  42.55 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2977  DNA binding domain protein, excisionase family  45.28 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.467459  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1601  DNA binding domain protein, excisionase family  47.92 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  41.3 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0288  excisionase, putative  40.68 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0830  DNA binding domain protein, excisionase family  44.07 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0663  DNA binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.292535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  38.98 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  41.3 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  42.31 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  41.3 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  48.84 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0403  DNA binding domain-containing protein  43.4 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00109148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  42.86 
 
 		 306 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  42.86 
 
 		 315 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2946  hypothetical protein  56.41 
 
 		 130 aa  43.5  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  41.86 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  42.31 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  40.82 
 
 		 306 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  40.82 
 
 		 306 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  40.82 
 
 		 306 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12334  excisionase  48.94 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7903  DNA binding domain protein, excisionase family  38.78 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  42.86 
 
 		 315 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  40.82 
 
 		 315 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  39.62 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  39.13 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1635  DNA binding domain protein, excisionase family  48 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0173  DNA binding domain protein, excisionase family  42.31 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  40.82 
 
 		 306 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  41.86 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  41.86 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 306 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  38.78 
 
 		 305 aa  41.6  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  47.17 
 
 		 136 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  41.86 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  46.15 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0183  excisionase/Xis, DNA-binding  38.3 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.50459 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  38.78 
 
 		 306 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4424  excisionase/Xis, DNA-binding  43.48 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412812  normal  0.513103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1174  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10758  transcriptional regulator  41.86 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.03304e-31  normal  0.354677 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  39.53 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0513  DNA binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.252241  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  44.19 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5748  excision promoter, Xis  40.43 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 315 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0783  DNA binding domain protein, excisionase family  57.89 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  40.82 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01190  DNA-binding protein, excisionase family  44.68 
 
 		 164 aa  40  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  47.37 
 
 		 80 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>