28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2977 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2977  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 98 aa  199  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.467459  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  42.62 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  45.61 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0061  DNA binding domain protein, excisionase family  48.08 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4561  DNA binding domain protein, excisionase family  41.18 
 
 		 335 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000373649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  43.86 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5521  DNA binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00471418  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0405  excisionase/Xis, DNA-binding  45.28 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  32.88 
 
 		 315 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  31.51 
 
 		 306 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  31.51 
 
 		 306 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  32.88 
 
 		 306 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  40.74 
 
 		 126 aa  42.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4283  DNA binding domain-containing protein  26.39 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.979443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  31.51 
 
 		 306 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  32.88 
 
 		 315 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  31.51 
 
 		 315 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1182  phage transcriptional regulator, AlpA  40.74 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  36.73 
 
 		 305 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8921  DNA binding domain protein, excisionase family  46.81 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0131376  normal  0.135259 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  34.55 
 
 		 320 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1536  DNA binding domain-containing protein  39.62 
 
 		 76 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  34.48 
 
 		 306 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1923  phage transcriptional regulator, AlpA  45.24 
 
 		 65 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151509  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5325  DNA binding domain-containing protein  44 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0330031 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0019  DNA binding domain protein, excisionase family  34.62 
 
 		 326 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  28.36 
 
 		 306 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 74 aa  40  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>