16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8921 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8921  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 57 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0131376  normal  0.135259 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0783  DNA binding domain protein, excisionase family  44.9 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15570  hypothetical protein  33.96 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000408648  unclonable  2.14199e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2531  phage transcriptional regulator, AlpA  33.96 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  hitchhiker  0.000129846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  43.4 
 
 		 84 aa  42  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2977  DNA binding domain protein, excisionase family  46.81 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.467459  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  41.18 
 
 		 112 aa  42  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  44 
 
 		 74 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  37.74 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  32 
 
 		 73 aa  40.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  41.51 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3678  excision promoter, Xis  36.36 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  31.48 
 
 		 56 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  31.37 
 
 		 75 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>