17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3678 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3678  excision promoter, Xis  100 
 
 		 97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0680  DNA binding domain protein, excisionase family  42.55 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  32.31 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13782  excisionase  30 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.696326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2286  DNA binding domain-containing protein  34.69 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3978  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.382776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  30.65 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1856  excisionase/Xis, DNA-binding  37.04 
 
 		 174 aa  40.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  31.25 
 
 		 180 aa  40.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8921  DNA binding domain protein, excisionase family  36.36 
 
 		 57 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0131376  normal  0.135259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  33.87 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0830  DNA binding domain protein, excisionase family  45 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2701  DNA binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5171  excisionase  31.88 
 
 		 91 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628893  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  40.43 
 
 		 64 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1410  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  31.08 
 
 		 73 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.251698  normal  0.111999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>