20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5171 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5171  excisionase  100 
 
 		 91 aa  186  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628893  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1463  excisionase  40.74 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00572875  normal  0.0821258 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0680  DNA binding domain protein, excisionase family  42.11 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0629  periplasmic substrate-binding protein  40 
 
 		 290 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2635  DNA binding domain-containing protein  46.15 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0624  DNA binding domain protein, excisionase family  35.82 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5334  DNA binding domain protein, excisionase family  41.82 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.329966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3590  DNA binding domain-containing protein  44.23 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3991  phage transcriptional regulator, AlpA  34.92 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1826  DNA binding domain protein, excisionase family  29.55 
 
 		 254 aa  43.5  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0048  DNA binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 296 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3096  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.773415  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1169  phage DNA-binding protein excisionase  35.85 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.704903  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3717  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 307 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.222458  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2701  DNA binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3033  excisionase/Xis, DNA-binding  36.49 
 
 		 304 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.627333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  37.5 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2438  DNA binding domain-containing protein  42 
 
 		 291 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5502  DNA binding domain-containing protein  40 
 
 		 291 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3678  excision promoter, Xis  31.88 
 
 		 97 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>