30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1463 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1463  excisionase  100 
 
 		 109 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00572875  normal  0.0821258 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0624  DNA binding domain protein, excisionase family  37.63 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0680  DNA binding domain protein, excisionase family  35.05 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2635  DNA binding domain-containing protein  38.67 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5171  excisionase  40.74 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628893  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_002950  PG0872  mobilizable transposon, Xis protein  39.06 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0188058 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03950  hypothetical protein  37 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.33907  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2701  DNA binding domain-containing protein  31.33 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00405  putative excisionase  32.47 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3590  DNA binding domain-containing protein  37.18 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3283  hypothetical protein  32.65 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5334  DNA binding domain protein, excisionase family  43.1 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.329966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3096  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.773415  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2211  hypothetical protein  28.05 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.953966  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1468  excisionase/Xis, DNA-binding  35 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118441  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1862  putative transcriptional regulator  31.88 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382901  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3682  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  35.85 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  26.98 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1169  phage DNA-binding protein excisionase  31.75 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.704903  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4255  DNA binding domain protein, excisionase family  34.78 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2727  DNA binding domain, excisionase family protein  25.93 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000622476  hitchhiker  0.000211315 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2595  DNA binding domain, excisionase family protein  36.54 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04063  VrlI like protein  31.48 
 
 		 65 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  41.18 
 
 		 56 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  31.82 
 
 		 676 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2195  phage transcriptional regulator, AlpA  32.81 
 
 		 70 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3430  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 84 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3991  phage transcriptional regulator, AlpA  31.15 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1224  hypothetical protein  30.16 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>