35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0680 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0680  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 116 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0624  DNA binding domain protein, excisionase family  57.89 
 
 		 116 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2701  DNA binding domain-containing protein  44.12 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1463  excisionase  35.05 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00572875  normal  0.0821258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5334  DNA binding domain protein, excisionase family  41.03 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.329966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3283  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_002950  PG0872  mobilizable transposon, Xis protein  41.82 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0188058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5171  excisionase  42.11 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628893  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2635  DNA binding domain-containing protein  38.03 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00405  putative excisionase  28.99 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526782  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03950  hypothetical protein  27.96 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.33907  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3991  phage transcriptional regulator, AlpA  33.8 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0629  periplasmic substrate-binding protein  37.29 
 
 		 290 aa  47  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5502  DNA binding domain-containing protein  44.23 
 
 		 291 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2438  DNA binding domain-containing protein  42 
 
 		 291 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2211  hypothetical protein  30.14 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.953966  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  40.38 
 
 		 180 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  40.38 
 
 		 180 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  40.38 
 
 		 180 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3678  excision promoter, Xis  42.55 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2727  DNA binding domain, excisionase family protein  30.14 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000622476  hitchhiker  0.000211315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1174  phage transcriptional regulator, AlpA  33.87 
 
 		 65 aa  43.5  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3590  DNA binding domain-containing protein  35.53 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04063  VrlI like protein  30.65 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2595  DNA binding domain, excisionase family protein  31.08 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0554  phage transcriptional regulator, AlpA  29.41 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0691  mobilizable transposon, xis protein  40.35 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3033  excisionase/Xis, DNA-binding  39.13 
 
 		 304 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.627333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3430  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2195  phage transcriptional regulator, AlpA  34.62 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  32.31 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3096  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.773415  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1862  putative transcriptional regulator  26.87 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382901  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3682  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  30.65 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1182  phage transcriptional regulator, AlpA  31.34 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592067  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>