23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0624 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0624  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 116 aa  239  9e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0680  DNA binding domain protein, excisionase family  57.89 
 
 		 116 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1463  excisionase  37.63 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00572875  normal  0.0821258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2635  DNA binding domain-containing protein  38.14 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2701  DNA binding domain-containing protein  41.27 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5334  DNA binding domain protein, excisionase family  39.74 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.329966 
 
 
-
 
NC_002950  PG0872  mobilizable transposon, Xis protein  32.53 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0188058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5171  excisionase  35.82 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628893  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2211  hypothetical protein  30.38 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.953966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2727  DNA binding domain, excisionase family protein  31.65 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000622476  hitchhiker  0.000211315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3283  hypothetical protein  36.51 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  44.9 
 
 		 180 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  44.9 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  44.9 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03950  hypothetical protein  35.19 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.33907  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00405  putative excisionase  25.76 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526782  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0691  mobilizable transposon, xis protein  34.18 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  35.19 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3590  DNA binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2595  DNA binding domain, excisionase family protein  31.65 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3033  excisionase/Xis, DNA-binding  33.85 
 
 		 304 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.627333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3096  phage transcriptional regulator, AlpA  35.59 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.773415  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2438  DNA binding domain-containing protein  40 
 
 		 291 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>