22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5334 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5334  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.329966 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3991  phage transcriptional regulator, AlpA  36.49 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00405  putative excisionase  31.91 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2701  DNA binding domain-containing protein  39.76 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4255  DNA binding domain protein, excisionase family  35.06 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0680  DNA binding domain protein, excisionase family  41.03 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0624  DNA binding domain protein, excisionase family  39.74 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3096  phage transcriptional regulator, AlpA  40.91 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.773415  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1463  excisionase  43.1 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00572875  normal  0.0821258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2635  DNA binding domain-containing protein  31.63 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5171  excisionase  41.82 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628893  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3590  DNA binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1169  phage DNA-binding protein excisionase  34.48 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.704903  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  42 
 
 		 73 aa  43.5  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0094  DNA binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0288586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3283  hypothetical protein  31.52 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 70 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0691  mobilizable transposon, xis protein  30.67 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1826  DNA binding domain protein, excisionase family  26.92 
 
 		 254 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  38.46 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0957  excision promoter, Xis  40.38 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.392434  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1468  excisionase/Xis, DNA-binding  37.7 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118441  normal  0.471472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>